More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1656 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  52.7 
 
 
728 aa  757    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  98.2 
 
 
763 aa  1437    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  60.61 
 
 
759 aa  871    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  98.2 
 
 
768 aa  1437    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  100 
 
 
720 aa  1466    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  43.58 
 
 
728 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  42.92 
 
 
728 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  43.34 
 
 
805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  45.23 
 
 
809 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  42.75 
 
 
819 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  44.56 
 
 
726 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  44.85 
 
 
772 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  44.85 
 
 
772 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  41.83 
 
 
729 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 
761 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  43.55 
 
 
737 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  42.71 
 
 
734 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  40.08 
 
 
753 aa  492  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 
729 aa  478  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 
755 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  38.03 
 
 
730 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  37.41 
 
 
737 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  38.8 
 
 
771 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  36.89 
 
 
724 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  38.49 
 
 
804 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 
801 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 
801 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  37.92 
 
 
804 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  37.6 
 
 
744 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 
768 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  37.06 
 
 
746 aa  432  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 
725 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  36.43 
 
 
800 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  37.95 
 
 
823 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  38.91 
 
 
777 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  37.81 
 
 
753 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 
802 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  37.98 
 
 
762 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  38.3 
 
 
722 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  37.1 
 
 
722 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 
808 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  37.23 
 
 
756 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  36.08 
 
 
754 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 
709 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 
764 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  37.89 
 
 
749 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  37.17 
 
 
764 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 
761 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 
773 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 
746 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  35.71 
 
 
730 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  35.92 
 
 
700 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 
712 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 
758 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 
804 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 
773 aa  372  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 
770 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 
839 aa  364  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  36.48 
 
 
851 aa  363  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  35.95 
 
 
742 aa  360  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  36.2 
 
 
879 aa  360  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 
731 aa  345  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  33.57 
 
 
804 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 
729 aa  343  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 
698 aa  203  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 
811 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 
730 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 
811 aa  193  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 
728 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.46 
 
 
705 aa  190  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 
727 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 
706 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 
751 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 
708 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 
743 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 
702 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 
742 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 
743 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
707 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
727 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 
702 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
707 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
707 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 
716 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.37 
 
 
724 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 
743 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 
743 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 
727 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 
738 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 
743 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 
743 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 
729 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 
710 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 
715 aa  167  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 
757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 
726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 
772 aa  165  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 
724 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 
685 aa  161  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 
774 aa  161  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>