More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1405 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  100 
 
 
312 aa  634    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  100 
 
 
312 aa  634    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  99.68 
 
 
312 aa  630  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  81.1 
 
 
316 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  69.62 
 
 
312 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  66.78 
 
 
312 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  69.77 
 
 
310 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  66.78 
 
 
312 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  66.78 
 
 
312 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  66.78 
 
 
312 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  66.78 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  66.36 
 
 
321 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  66.89 
 
 
313 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  66.89 
 
 
313 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  67.24 
 
 
313 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  67.24 
 
 
313 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  66.89 
 
 
313 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  67.24 
 
 
313 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  67.24 
 
 
313 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  67.58 
 
 
313 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  47.8 
 
 
352 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  48.39 
 
 
298 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  46.23 
 
 
340 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  46.92 
 
 
333 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  48.44 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 
310 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  46.76 
 
 
325 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 
325 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  43.01 
 
 
306 aa  235  7e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  44.13 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  43.53 
 
 
299 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  43.32 
 
 
299 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 
299 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  41.48 
 
 
312 aa  226  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  42.81 
 
 
299 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  41.13 
 
 
307 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 
326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.75 
 
 
299 aa  215  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.75 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  42.37 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.98 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.98 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
342 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  40.36 
 
 
315 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  42.37 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  40.5 
 
 
305 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  40.5 
 
 
305 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.48 
 
 
300 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 
300 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 
305 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  44.62 
 
 
327 aa  207  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  42.27 
 
 
305 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  40.29 
 
 
301 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
301 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
301 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
301 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  36.31 
 
 
398 aa  202  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  37.81 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  39.79 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.22 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  38.36 
 
 
317 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  38.18 
 
 
313 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 
317 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 
328 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 
298 aa  188  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 
311 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  40.85 
 
 
356 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
304 aa  186  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 
339 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.48 
 
 
299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  39.24 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  39.6 
 
 
378 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
316 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 
626 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  37.34 
 
 
306 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 
607 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 
300 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 
309 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 
298 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
299 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 
326 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 
342 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 
324 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 
305 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 
319 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 
319 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  43.9 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  39.14 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
294 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  39.47 
 
 
359 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  38.85 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>