52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1358 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1358  putative DNA-binding prophage protein  100 
 
 		 46 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.190658  hitchhiker  0.000534909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0017  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.447593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4949  putative transcriptional regulator  53.85 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3002  addiction module antidote protein  55.26 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  51.11 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  51.28 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  51.28 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2314  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3743  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4583  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205891  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  51.28 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5507  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3672  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.932392  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3780  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.798445  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3155  putative transcriptional regulator  51.28 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0171  addiction module antidote protein  46.15 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4952  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0184  putative transcriptional regulator  51.43 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.57004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  55.56 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3174  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1150  hypothetical protein  43.59 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0368  addiction module antidote protein  43.59 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235004 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  48.72 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3123  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2537  putative transcriptional regulator  48.72 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.35922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1725  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3082  transcriptional regulator  54.29 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9109  hypothetical protein  50 
 
 		 286 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  48.72 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  48.72 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40590  transcriptional regulator protein  42.11 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6941  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3926  putative transcriptional regulator  48.72 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.511666 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0146  addiction module antidote protein  43.59 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1813  hypothetical protein  43.59 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1332  putative transcriptional regulator  44.74 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.043655 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6535  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 121 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1631  hypothetical protein  44.74 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1295  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 121 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.053916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2280  transcriptional regulator-like  42.11 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  0.372156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4018  putative transcriptional regulator  41.03 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05545  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0174  putative addiction module antidote protein  48.57 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0420  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.461361  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1155  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 275 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163993  unclonable  0.000000164707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>