15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1252 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  98.56 
 
 		 1122 bp  779    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1252    100 
 
 		 417 bp  827    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222076  hitchhiker  0.000000000000073078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  98.56 
 
 		 1122 bp  779    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4199  GDP-mannose 4,6-dehydratase  83.46 
 
 		 1125 bp  85.7  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  83.74 
 
 		 1128 bp  85.7  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  86.75 
 
 		 1125 bp  77.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1312  GDP-mannose 4,6-dehydratase  84.16 
 
 		 1110 bp  73.8  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01959  GDP-D-mannose dehydratase, NAD(P)-binding  88 
 
 		 1122 bp  52  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2988  GDP-mannose 4,6-dehydratase  92.11 
 
 		 1122 bp  52  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01948    88 
 
 		 1121 bp  52  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2623  GDP-mannose 4,6-dehydratase  85.71 
 
 		 1122 bp  48.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2968  GDP-mannose 4,6-dehydratase  85.71 
 
 		 1119 bp  48.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  89.74 
 
 		 1122 bp  46.1  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.878549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  91.43 
 
 		 1086 bp  46.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1588  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.23 
 
 		 1122 bp  46.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>