43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1251 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  99.23 
 
 		 1122 bp  989    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1251    100 
 
 		 519 bp  1029    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285562  hitchhiker  0.0000000000000757963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  99.23 
 
 		 1122 bp  989    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4199  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.69 
 
 		 1125 bp  89.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.09 
 
 		 1122 bp  85.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.34 
 
 		 1080 bp  77.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1407  GDP-mannose 4,6-dehydratase  86.05 
 
 		 1155 bp  75.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000685892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1312  GDP-mannose 4,6-dehydratase  87.18 
 
 		 1110 bp  75.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2968  GDP-mannose 4,6-dehydratase  83.05 
 
 		 1119 bp  75.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4001  GDP-mannose 4,6-dehydratase  89.55 
 
 		 1137 bp  69.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  84.34 
 
 		 1086 bp  61.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  92.16 
 
 		 1113 bp  61.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2291  GDP-mannose 4,6-dehydratase  82.24 
 
 		 1122 bp  61.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.76213  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  88.89 
 
 		 1089 bp  60  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  88.89 
 
 		 1089 bp  60  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2988  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.39 
 
 		 1122 bp  58  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.45 
 
 		 1122 bp  58  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2335  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.45 
 
 		 1122 bp  58  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575039 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0302  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.15 
 
 		 1131 bp  56  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  96.88 
 
 		 1113 bp  56  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  88.46 
 
 		 1119 bp  56  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2623  GDP-mannose 4,6-dehydratase  94.29 
 
 		 1122 bp  54  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1482  GDP-mannose 4,6-dehydratase  83.54 
 
 		 1122 bp  54  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  94.29 
 
 		 1047 bp  54  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0652  GDP-mannose 4,6-dehydratase  88.24 
 
 		 1203 bp  54  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  94.29 
 
 		 1047 bp  54  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2694  GDP-mannose 4,6-dehydratase  90.24 
 
 		 1206 bp  50.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.093727 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  85.25 
 
 		 1122 bp  50.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.878549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80.95 
 
 		 1128 bp  50.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2608  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80 
 
 		 1194 bp  50.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000935009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  86.79 
 
 		 1122 bp  50.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0119174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  86.79 
 
 		 1122 bp  50.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1588  GDP-mannose 4,6-dehydratase  85.25 
 
 		 1122 bp  50.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1179  GDP-mannose 4,6-dehydratase  85.25 
 
 		 1122 bp  50.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01959  GDP-D-mannose dehydratase, NAD(P)-binding  85.71 
 
 		 1122 bp  48.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01948    85.71 
 
 		 1121 bp  48.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  96.43 
 
 		 1002 bp  48.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5153  GDP-mannose 4,6-dehydratase  82.89 
 
 		 1113 bp  48.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000400711  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  81.61 
 
 		 1062 bp  46.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2346  GDP-mannose 4,6-dehydratase  80 
 
 		 1122 bp  46.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  89.74 
 
 		 1092 bp  46.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  91.43 
 
 		 1104 bp  46.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0571  GDP-mannose 4,6-dehydratase  84.75 
 
 		 1143 bp  46.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>