35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1243 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  33.59 
 
 		 609 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  30.3 
 
 		 587 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  38.46 
 
 		 674 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  32 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  31.03 
 
 		 989 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  35.4 
 
 		 684 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  32.52 
 
 		 720 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  29.81 
 
 		 756 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  29.68 
 
 		 723 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  27.27 
 
 		 738 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  27.84 
 
 		 796 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  25 
 
 		 364 aa  48.5  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  36.08 
 
 		 774 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  30.63 
 
 		 662 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0109  hypothetical protein  33.68 
 
 		 672 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  32.41 
 
 		 719 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  29.46 
 
 		 994 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  29.66 
 
 		 361 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  26.82 
 
 		 945 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4284  hypothetical protein  30.05 
 
 		 611 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  26.24 
 
 		 673 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  35.14 
 
 		 679 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  34.04 
 
 		 771 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  30.63 
 
 		 651 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  29 
 
 		 987 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  29.06 
 
 		 638 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  32.59 
 
 		 608 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  26.11 
 
 		 629 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  30.27 
 
 		 584 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  32.99 
 
 		 774 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  28.85 
 
 		 784 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  26.42 
 
 		 594 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  28.8 
 
 		 629 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  28.8 
 
 		 629 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>