49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1240 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  910    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  40.78 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  40.38 
 
 		 428 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  36.41 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  31.34 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  31.18 
 
 		 424 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  31.04 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  31.89 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  30.7 
 
 		 418 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  33.74 
 
 		 428 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  33.14 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  28.71 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  41.38 
 
 		 273 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  41.64 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  29.16 
 
 		 422 aa  180  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  28.74 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  28.83 
 
 		 443 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  28.57 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  29.75 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  30.35 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  27.36 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  28.86 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  29.14 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  24.27 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.46 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.98 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.22 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  21.9 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.16 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.25 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0026  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.02 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.579056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.49 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  30.98 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  27.2 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  23.05 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  25.4 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  21.16 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.75 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  21 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4503  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  23.16 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.544571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  29.66 
 
 		 406 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0972  hypothetical protein  23.81 
 
 		 431 aa  53.1  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.241373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0783  5-methylcytosine restriction system component- like protein  23.24 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  33.33 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  22.4 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.816052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2839  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  24.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3753  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24 
 
 		 351 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.537146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  19.6 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>