98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1051 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  99.56 
 
 
238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  60.96 
 
 
259 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  54.59 
 
 
244 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  35.82 
 
 
211 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  36.56 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  35.53 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  34.55 
 
 
212 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 
210 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  31.34 
 
 
207 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  35.07 
 
 
210 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  34.43 
 
 
221 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 
210 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 
210 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  34.76 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  33.51 
 
 
210 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
221 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  31.4 
 
 
221 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  30.57 
 
 
209 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  29.05 
 
 
223 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
199 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
210 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.19 
 
 
209 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  27.88 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  31.07 
 
 
210 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  29.72 
 
 
242 aa  91.7  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  29.23 
 
 
208 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  23.92 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  25 
 
 
198 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  27.4 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  27.4 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  27.4 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  24.04 
 
 
206 aa  82  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  26.57 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  23.3 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  26.6 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  23.12 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  27.55 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  24.76 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  30.41 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  26.77 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  27.78 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  29.59 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  22.92 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  28.77 
 
 
256 aa  72  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  25.62 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  25.13 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  30.46 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  23.56 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  25.25 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  27.92 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  27.08 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  21.46 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  27.08 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  27.08 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  26.02 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  23.18 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  27.92 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  23.32 
 
 
209 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  23.9 
 
 
303 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  29.21 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  23.15 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  26.9 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  25 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  21.76 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  22.28 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  23.38 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  21.76 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  26.73 
 
 
336 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  25.6 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  22.77 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2525  iso-IS1 ORF2  95 
 
 
44 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  23.7 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  24.53 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  28.31 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  24.62 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3337  twitching mobility protein  53.33 
 
 
207 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  23.44 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  100 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1304  putative quinone oxidoreductase  85 
 
 
97 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0316  phage family integrase  100 
 
 
160 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136682  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  24.83 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  28.03 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3152  phage family integrase  100 
 
 
45 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  19.25 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  22.44 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  25 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  20.99 
 
 
231 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>