263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0952 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
151 aa  313  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
151 aa  313  6e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
151 aa  313  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  68.03 
 
 
152 aa  209  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  65.31 
 
 
152 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  65.31 
 
 
152 aa  200  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  58.78 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  57.53 
 
 
149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  55.41 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  55.41 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  55.41 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  55.41 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  55.41 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  55.41 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  55.41 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  54.42 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  54.42 
 
 
148 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  54.79 
 
 
166 aa  169  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  53.02 
 
 
153 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  53.79 
 
 
149 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  54.42 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  54.55 
 
 
153 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.41 
 
 
152 aa  153  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  51.68 
 
 
159 aa  147  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  49.32 
 
 
149 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  49.32 
 
 
322 aa  143  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  46.71 
 
 
149 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  46.71 
 
 
149 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.58 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  48.95 
 
 
158 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  44.52 
 
 
152 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  52.94 
 
 
145 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  43.92 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.63 
 
 
148 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  47.52 
 
 
181 aa  133  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  46.94 
 
 
148 aa  133  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  49.32 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  42.86 
 
 
148 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  44.22 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  44.22 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  44.22 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  44.22 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  43.54 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.39 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.14 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  43.84 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  40.41 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  41.78 
 
 
149 aa  127  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.89 
 
 
145 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  44.59 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  43.88 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  45.83 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.53 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.68 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.9 
 
 
163 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  45.7 
 
 
169 aa  124  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  39.31 
 
 
147 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  39.31 
 
 
147 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  41.89 
 
 
156 aa  122  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.04 
 
 
153 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  38.62 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  45.58 
 
 
171 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.82 
 
 
152 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  41.38 
 
 
151 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  45.33 
 
 
159 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  45.33 
 
 
159 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  45.33 
 
 
159 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44.09 
 
 
142 aa  121  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  43.84 
 
 
148 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  44.3 
 
 
165 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.5 
 
 
149 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  43.75 
 
 
162 aa  120  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  43.51 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  42.57 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  43.54 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  44.37 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  42.75 
 
 
152 aa  118  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  42.75 
 
 
152 aa  118  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  43.24 
 
 
160 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.47 
 
 
147 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  43.84 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  37.32 
 
 
148 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
149 aa  117  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  43.26 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  41.78 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.78 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.47 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.41 
 
 
151 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29800  ribose 5-phosphate isomerase  43.05 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  41.98 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.55 
 
 
147 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0757  ribose-5-phosphate isomerase B  39.6 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>