More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0728 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  64.01 
 
 
565 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  63.67 
 
 
565 aa  751    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  75.51 
 
 
561 aa  853    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  60.98 
 
 
570 aa  712    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  99.66 
 
 
595 aa  1200    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  64.01 
 
 
565 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  99.66 
 
 
595 aa  1200    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.67 
 
 
565 aa  753    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.67 
 
 
565 aa  756    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  64.18 
 
 
567 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.84 
 
 
565 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  65.71 
 
 
583 aa  777    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.84 
 
 
565 aa  756    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.84 
 
 
567 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.56 
 
 
572 aa  731    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.84 
 
 
567 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.67 
 
 
567 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  64.01 
 
 
565 aa  756    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  64.01 
 
 
567 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  66.44 
 
 
583 aa  781    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  100 
 
 
595 aa  1203    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  63.84 
 
 
565 aa  756    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  65.03 
 
 
563 aa  753    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  52.71 
 
 
603 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.59 
 
 
600 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  51.54 
 
 
592 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  48.88 
 
 
624 aa  551  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.84 
 
 
631 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.96 
 
 
592 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.52 
 
 
608 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.25 
 
 
610 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.98 
 
 
609 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.83 
 
 
619 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.13 
 
 
619 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.09 
 
 
611 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.04 
 
 
619 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.42 
 
 
613 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.42 
 
 
613 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.67 
 
 
619 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.72 
 
 
604 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.7 
 
 
570 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.71 
 
 
613 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.47 
 
 
602 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.73 
 
 
607 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.17 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.98 
 
 
628 aa  465  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.37 
 
 
610 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.97 
 
 
586 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.56 
 
 
810 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  36.38 
 
 
731 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  39.14 
 
 
629 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  37.79 
 
 
649 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.69 
 
 
613 aa  360  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.48 
 
 
789 aa  360  5e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.92 
 
 
624 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  37.37 
 
 
750 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.54 
 
 
624 aa  353  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  38.02 
 
 
630 aa  353  5e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.04 
 
 
626 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  38.32 
 
 
642 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  36.32 
 
 
623 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.8 
 
 
589 aa  348  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.17 
 
 
612 aa  343  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  37.52 
 
 
622 aa  342  8e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  39.72 
 
 
604 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.41 
 
 
616 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.41 
 
 
616 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  36.3 
 
 
625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  38.41 
 
 
577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  37.8 
 
 
603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  36.88 
 
 
608 aa  337  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  37.75 
 
 
623 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  34.09 
 
 
586 aa  335  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  37.09 
 
 
605 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  33.92 
 
 
586 aa  331  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.7 
 
 
602 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  37.09 
 
 
745 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  35.46 
 
 
610 aa  327  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  39.38 
 
 
570 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  35.07 
 
 
632 aa  325  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  35.7 
 
 
626 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  35.33 
 
 
611 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.29 
 
 
628 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  33.23 
 
 
654 aa  321  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.11 
 
 
654 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.17 
 
 
606 aa  319  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.85 
 
 
612 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.13 
 
 
752 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.25 
 
 
611 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  35.33 
 
 
611 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  35.81 
 
 
618 aa  317  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  34.75 
 
 
615 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  34.75 
 
 
615 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  34.88 
 
 
631 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  36.89 
 
 
600 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  34.8 
 
 
617 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.46 
 
 
590 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  38.37 
 
 
589 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.95 
 
 
590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  38.09 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>