287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0499 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  100 
 
 
272 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  44.1 
 
 
275 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  46.98 
 
 
237 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  46.95 
 
 
238 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  39.36 
 
 
314 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  39.56 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  39.56 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  45.75 
 
 
238 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
243 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
243 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  36.05 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  41.38 
 
 
229 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.7 
 
 
243 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  33.33 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  35.91 
 
 
241 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0429  fimbrial chaperone protein  37.66 
 
 
252 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193885  hitchhiker  0.000207785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0376  fimbrial chaperone protein  37.66 
 
 
252 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.187051  normal  0.269695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0389  fimbrial chaperone protein  39.73 
 
 
252 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0895943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
267 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
267 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
267 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0367  fimbrial chaperone protein  36.97 
 
 
252 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.687788 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.43 
 
 
244 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  34.39 
 
 
266 aa  141  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.39 
 
 
266 aa  141  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0369  fimbrial chaperone protein  37.24 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  34.32 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  34.32 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  32.91 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  32.91 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  32.91 
 
 
267 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  34.32 
 
 
245 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  35.06 
 
 
241 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.07 
 
 
248 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  32.91 
 
 
309 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  35.37 
 
 
242 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.33 
 
 
245 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0302  pili assembly chaperone  34.18 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35 
 
 
243 aa  134  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  34.19 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  34.09 
 
 
236 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.09 
 
 
245 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  34.09 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.68 
 
 
265 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  34.87 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  34.41 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  33.76 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.66 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  36.51 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  34.87 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.19 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  36.75 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  36.75 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  31.73 
 
 
256 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.77 
 
 
248 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.67 
 
 
246 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
253 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  40.12 
 
 
248 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
248 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  31.82 
 
 
246 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  34.33 
 
 
253 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  34.68 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.27 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  35.1 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  35.21 
 
 
248 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  35.1 
 
 
243 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  34.74 
 
 
248 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  34.74 
 
 
263 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  35 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  34.88 
 
 
248 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  32.88 
 
 
248 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  35.19 
 
 
250 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  33.16 
 
 
246 aa  118  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  33.16 
 
 
246 aa  118  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  33.16 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  33.61 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  33.16 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  32.42 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.17 
 
 
251 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 
257 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.78 
 
 
252 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  34.33 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  34.27 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  34.33 
 
 
227 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  34.33 
 
 
227 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  34.33 
 
 
227 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
226 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.83 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.9 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  32.92 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  33.85 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.9 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  33.88 
 
 
251 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  32.02 
 
 
227 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.76 
 
 
248 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  30.9 
 
 
237 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>