17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0490 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0490  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  610  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00212165  normal  0.142676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4054  hypothetical protein  99.66 
 
 
292 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0161  hypothetical protein  89.73 
 
 
292 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1202  hypothetical protein  66.9 
 
 
282 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4043  hypothetical protein  61.11 
 
 
282 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4054  hypothetical protein  50.18 
 
 
289 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0108  hypothetical protein  48.24 
 
 
289 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  43.62 
 
 
371 aa  251  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0116  hypothetical protein  41.24 
 
 
271 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0132  hypothetical protein  40.89 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5258  hypothetical protein  39.55 
 
 
282 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03694  conserved hypothetical protein  39.18 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03643  hypothetical protein  39.18 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4338  hypothetical protein  38.81 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4185  hypothetical protein  39.18 
 
 
282 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3259  hypothetical protein  33.33 
 
 
548 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.592619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5895  hypothetical protein  25.95 
 
 
465 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>