163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0402 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  99.14 
 
 
348 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  100 
 
 
348 aa  721    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  99.43 
 
 
348 aa  718    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  85.3 
 
 
348 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  78.39 
 
 
347 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  77.23 
 
 
347 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  76.01 
 
 
347 aa  569  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  74.06 
 
 
349 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  72.13 
 
 
348 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  72.13 
 
 
348 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  72.41 
 
 
348 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  72.41 
 
 
348 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  72.99 
 
 
348 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  72.13 
 
 
348 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  72.13 
 
 
348 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  72.99 
 
 
348 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  72.13 
 
 
348 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  72.99 
 
 
348 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  72.13 
 
 
348 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  72.99 
 
 
348 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  72.7 
 
 
348 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  72.13 
 
 
348 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  70.11 
 
 
348 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0441  dihydroorotase  64.84 
 
 
364 aa  484  1e-136  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  66.18 
 
 
351 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  60.7 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  59.59 
 
 
340 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  56.73 
 
 
346 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  58.41 
 
 
348 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  55.85 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  55.16 
 
 
348 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  55.72 
 
 
347 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  55.72 
 
 
347 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  55.72 
 
 
347 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  54.87 
 
 
348 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  55.46 
 
 
348 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  54.97 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  55.2 
 
 
346 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  55.75 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  55.33 
 
 
354 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  55.62 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  55.62 
 
 
364 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  56.01 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  55.62 
 
 
364 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  55.62 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  55.13 
 
 
343 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  53.85 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  54.57 
 
 
348 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  54.65 
 
 
348 aa  398  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  54.97 
 
 
344 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  55.75 
 
 
348 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  56.85 
 
 
343 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  53.98 
 
 
354 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  55.16 
 
 
348 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  56.01 
 
 
343 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  55.46 
 
 
348 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  55.29 
 
 
344 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  53.69 
 
 
354 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  54.65 
 
 
346 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  55.2 
 
 
354 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  54.71 
 
 
344 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  55.29 
 
 
342 aa  391  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  57.44 
 
 
345 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  55.85 
 
 
343 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  54.12 
 
 
347 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  55 
 
 
344 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  56.01 
 
 
343 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  55 
 
 
344 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  55.36 
 
 
364 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  56.01 
 
 
343 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  54.28 
 
 
359 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  55.72 
 
 
343 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  54.62 
 
 
352 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  55.59 
 
 
342 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  55.72 
 
 
343 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  54.84 
 
 
350 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  56.01 
 
 
343 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  54.34 
 
 
352 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  54.34 
 
 
378 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  54.84 
 
 
342 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  54.02 
 
 
352 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  52.74 
 
 
353 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  53.67 
 
 
343 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  55.13 
 
 
355 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  56.85 
 
 
344 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  54.34 
 
 
352 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  55.13 
 
 
345 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  55.95 
 
 
344 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  54.23 
 
 
348 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  54.34 
 
 
352 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  55.06 
 
 
344 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  54.34 
 
 
352 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  54.34 
 
 
352 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  53.37 
 
 
342 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  54.68 
 
 
351 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  53.53 
 
 
347 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  54.41 
 
 
345 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  53.53 
 
 
344 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  53.51 
 
 
348 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06251  dihydroorotase  53.6 
 
 
349 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>