111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0347 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  74.32 
 
 
183 aa  285  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  67.76 
 
 
183 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  67.76 
 
 
183 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  68.31 
 
 
183 aa  262  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  68.68 
 
 
184 aa  260  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  68.68 
 
 
183 aa  260  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  68.68 
 
 
184 aa  260  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  69.95 
 
 
183 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  69.95 
 
 
183 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  69.95 
 
 
183 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  69.95 
 
 
183 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  69.95 
 
 
183 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  67.21 
 
 
183 aa  256  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  65.03 
 
 
183 aa  255  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  60.8 
 
 
185 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  57.95 
 
 
183 aa  217  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  56.83 
 
 
187 aa  214  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  56.98 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  57.87 
 
 
193 aa  209  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  57.78 
 
 
189 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  54.95 
 
 
181 aa  208  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  50.28 
 
 
186 aa  174  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  45.65 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  41.76 
 
 
187 aa  157  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  48.88 
 
 
182 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  43.58 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.5 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  43.93 
 
 
174 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.46 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  39.89 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  35.14 
 
 
181 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  40.61 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  37.35 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  35 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.22 
 
 
186 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.07 
 
 
187 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  34.04 
 
 
184 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  35.85 
 
 
196 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  34.84 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.64 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  37.01 
 
 
188 aa  92  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.66 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.09 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  25.76 
 
 
254 aa  57.8  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.13 
 
 
232 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  25.25 
 
 
254 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.68 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.55 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.67 
 
 
162 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.63 
 
 
232 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.76 
 
 
227 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
249 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
246 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  27.42 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  31.86 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.39 
 
 
156 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.22 
 
 
159 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.91 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.37 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  29.11 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.44 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.5 
 
 
234 aa  48.5  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.65 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.23 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  27.44 
 
 
271 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  25.36 
 
 
239 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  25 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  26.97 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  24.53 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  25.77 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  25.77 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  28.65 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  28.73 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  24.77 
 
 
238 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.07 
 
 
181 aa  45.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  22.56 
 
 
173 aa  44.7  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.98 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  21.89 
 
 
168 aa  44.3  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  26.37 
 
 
233 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  24.35 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  27.93 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  23.9 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  35.05 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.58 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.25 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  37.68 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  30.09 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.72 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.84 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  26.25 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.32 
 
 
222 aa  42.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>