More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0224 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
413 aa  837    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  85.96 
 
 
402 aa  708    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  47.56 
 
 
395 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  47.02 
 
 
400 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  47.02 
 
 
400 aa  359  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  45.8 
 
 
399 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  45.45 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  43.4 
 
 
398 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  43.3 
 
 
398 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  41.65 
 
 
395 aa  299  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  41.4 
 
 
395 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  41.69 
 
 
395 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  41.93 
 
 
395 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  41.01 
 
 
402 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4674  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  41.06 
 
 
389 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  41.25 
 
 
402 aa  288  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  40.8 
 
 
407 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  40.8 
 
 
407 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  39.6 
 
 
440 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  38.39 
 
 
438 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  38.48 
 
 
440 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  36.81 
 
 
441 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
442 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  37.74 
 
 
405 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  39.24 
 
 
399 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  36.41 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  34.97 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  36.01 
 
 
451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  39.66 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  34.54 
 
 
462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  35.81 
 
 
442 aa  239  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  36.56 
 
 
408 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  39.72 
 
 
401 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  39.48 
 
 
401 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  39.24 
 
 
402 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  39.24 
 
 
402 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  36.68 
 
 
408 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  34.68 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.43 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  39.01 
 
 
402 aa  235  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  39.24 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  39.24 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  37.23 
 
 
404 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  38.86 
 
 
403 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  38.86 
 
 
403 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  38.86 
 
 
403 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  36.26 
 
 
420 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  38.33 
 
 
402 aa  232  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 
405 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.35 
 
 
418 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  38.86 
 
 
403 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  38.86 
 
 
403 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  36.62 
 
 
454 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  38.26 
 
 
387 aa  229  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  36.32 
 
 
453 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  36.11 
 
 
453 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  34.47 
 
 
437 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  34.47 
 
 
437 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  36.04 
 
 
453 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  35.93 
 
 
425 aa  227  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  35.5 
 
 
453 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.26 
 
 
430 aa  226  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  35.59 
 
 
453 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  35.59 
 
 
453 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  35.97 
 
 
406 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  38.34 
 
 
418 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  34.33 
 
 
460 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 
455 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  33.97 
 
 
410 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  37.77 
 
 
404 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  35.06 
 
 
453 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.26 
 
 
435 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  34.52 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  34.52 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.59 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  33.92 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  35.57 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  35.52 
 
 
413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  36.64 
 
 
459 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  38.04 
 
 
407 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  34.34 
 
 
453 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  34.34 
 
 
453 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  34.34 
 
 
453 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 
413 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 
413 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  34.9 
 
 
428 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  34.9 
 
 
428 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  34.9 
 
 
428 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  35.07 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 
413 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  34.87 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  35.76 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
413 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
413 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
413 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
413 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
413 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
413 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
413 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  36.74 
 
 
413 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>