252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0218 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  88.52 
 
 		 453 aa  827    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 453 aa  931    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  38.51 
 
 		 458 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  38.29 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  35.45 
 
 		 457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  38 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  34.35 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  35.08 
 
 		 457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  35.09 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  35.15 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  31.89 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  33.77 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  33.12 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  30.02 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  32.53 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  29.22 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.92 
 
 		 680 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 		 681 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.61 
 
 		 680 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 		 683 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  32.32 
 
 		 688 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.17 
 
 		 458 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  29.19 
 
 		 682 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 695 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.58 
 
 		 920 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31.69 
 
 		 682 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.84 
 
 		 652 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  29.45 
 
 		 539 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 		 547 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 		 547 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  30.06 
 
 		 541 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 		 547 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 		 547 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 		 547 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 		 649 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 		 649 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  32.18 
 
 		 637 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  29.61 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 		 683 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  29.61 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  25.22 
 
 		 464 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  29.5 
 
 		 676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.23 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  27.75 
 
 		 685 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 631 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 		 546 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  24.68 
 
 		 471 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  30.89 
 
 		 658 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  30.98 
 
 		 640 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26.12 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 638 aa  119  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 		 631 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 		 645 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 		 657 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.72 
 
 		 647 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.1 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 		 637 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.1 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.1 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  30.16 
 
 		 640 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.86 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.73 
 
 		 549 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 		 624 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 		 660 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 		 624 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 		 629 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  25.79 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  26.26 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  23.39 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  26.68 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  26.32 
 
 		 642 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  22.82 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  26.07 
 
 		 686 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  25.34 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 642 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  27.11 
 
 		 686 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 640 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  26.57 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  28.44 
 
 		 638 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 		 641 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 		 641 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  28.78 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  23.79 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 		 568 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  26.93 
 
 		 641 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 		 645 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>