More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0117 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  100 
 
 
243 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  100 
 
 
243 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  100 
 
 
243 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  92.18 
 
 
243 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  86.31 
 
 
243 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  81.33 
 
 
247 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  78.84 
 
 
242 aa  421  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  79.67 
 
 
242 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  77.59 
 
 
242 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  72.03 
 
 
238 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  70.54 
 
 
243 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  70.54 
 
 
243 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  69.71 
 
 
243 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  68.75 
 
 
246 aa  367  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  68.72 
 
 
251 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  66.39 
 
 
259 aa  358  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  66.94 
 
 
247 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  66.94 
 
 
247 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  66.53 
 
 
247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  63.75 
 
 
249 aa  350  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  63.49 
 
 
248 aa  345  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  65.98 
 
 
243 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  65.15 
 
 
248 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  63.07 
 
 
248 aa  340  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  63.37 
 
 
245 aa  339  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  63.9 
 
 
245 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  63.49 
 
 
242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  64.58 
 
 
247 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  63.9 
 
 
243 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  59.41 
 
 
249 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  61.08 
 
 
176 aa  208  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  60.48 
 
 
174 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  61.08 
 
 
175 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  56.83 
 
 
190 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.68 
 
 
175 aa  198  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  56.89 
 
 
190 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  56.21 
 
 
190 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  55.36 
 
 
189 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  50.84 
 
 
189 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  51.76 
 
 
179 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  50.3 
 
 
175 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  49.41 
 
 
179 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  48.82 
 
 
182 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  48.82 
 
 
182 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  49.41 
 
 
181 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  48.35 
 
 
233 aa  162  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  45.35 
 
 
188 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  50.32 
 
 
159 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  43.43 
 
 
179 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  47.47 
 
 
160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  47.8 
 
 
157 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  44.17 
 
 
160 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  43.27 
 
 
184 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  45.28 
 
 
157 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  44.65 
 
 
157 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  43.9 
 
 
160 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.95 
 
 
157 aa  138  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  47.56 
 
 
161 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.03 
 
 
158 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  44.51 
 
 
160 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  43.9 
 
 
162 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  47.56 
 
 
163 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  44.3 
 
 
157 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  44.3 
 
 
157 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  44.3 
 
 
157 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  44.3 
 
 
178 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  43.67 
 
 
157 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  43.4 
 
 
157 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.26 
 
 
157 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.56 
 
 
167 aa  135  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  43.04 
 
 
157 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  43.04 
 
 
157 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  43.04 
 
 
157 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.04 
 
 
159 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  42.68 
 
 
157 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  43.4 
 
 
157 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 
159 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  43.4 
 
 
162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  42.68 
 
 
160 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  42.68 
 
 
160 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  42.07 
 
 
160 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  46.01 
 
 
161 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  46.34 
 
 
161 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  44.38 
 
 
158 aa  131  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.79 
 
 
161 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.31 
 
 
157 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  41.88 
 
 
161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  50.35 
 
 
168 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  43.56 
 
 
161 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  39.87 
 
 
160 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.13 
 
 
158 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  43.9 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  41.07 
 
 
167 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  40.24 
 
 
160 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  40.49 
 
 
161 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  48.84 
 
 
168 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0951  putative peroxiredoxin  49.64 
 
 
145 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.148763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  42.77 
 
 
166 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  47.37 
 
 
169 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.39 
 
 
168 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>