85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0040 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  100 
 
 
404 aa  798    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
404 aa  798    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  99.75 
 
 
404 aa  798    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0052  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
401 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4872  sodium/glutamate symporter  84.33 
 
 
403 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854487  normal  0.0119787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4157  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
401 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3864  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
401 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0058  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
401 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3988  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
401 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4104  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
401 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5026  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
401 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03463  hypothetical protein  82.46 
 
 
401 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03511  glutamate transporter  82.46 
 
 
401 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3953  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
401 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4132  sodium/glutamate symporter  82.21 
 
 
401 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0214352  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4072  sodium/glutamate symporter  81.7 
 
 
401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4026  sodium/glutamate symporter  81.95 
 
 
401 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3963  sodium/glutamate symporter  81.7 
 
 
401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0996  sodium/glutamate symporter  67.08 
 
 
401 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4228  sodium/glutamate symporter  68.58 
 
 
401 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0724268  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1033  sodium/glutamate symporter  66.58 
 
 
401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0995  sodium/glutamate symporter  66.5 
 
 
401 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  56.38 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000567531  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  54.14 
 
 
404 aa  410  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  53.87 
 
 
409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4718  sodium/glutamate symporter  52.55 
 
 
401 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0916  sodium/glutamate symport carrier protein  57.39 
 
 
402 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.920005  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  50.24 
 
 
424 aa  378  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  49.76 
 
 
424 aa  371  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  51.39 
 
 
404 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  51.39 
 
 
404 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2020  sodium/glutamate symporter  51.98 
 
 
412 aa  363  3e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.733127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  49.36 
 
 
408 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  47.69 
 
 
417 aa  359  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  47.31 
 
 
407 aa  349  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  48.46 
 
 
407 aa  349  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3251  sodium/glutamate symporter  46.63 
 
 
407 aa  343  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2389  sodium/glutamate symporter  47.36 
 
 
407 aa  341  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.657227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  46.21 
 
 
428 aa  339  5e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  47 
 
 
407 aa  338  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2923  sodium/glutamate symporter  46.46 
 
 
407 aa  338  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  47.75 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4778  sodium/glutamate symporter  47.85 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07017  hypothetical protein  46.57 
 
 
420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4777  sodium/glutamate symporter  47.85 
 
 
407 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0118  sodium/glutamate symporter  48 
 
 
407 aa  329  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2781  sodium/glutamate symporter  47.33 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.689609  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1682  sodium/glutamate symporter  47.33 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00781316  normal  0.0287357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2705  sodium/glutamate symporter  47.33 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1547  sodium/glutamate symporter  47.85 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1541  sodium/glutamate symporter  47.31 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2684  sodium/glutamate symporter  47.33 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1482  sodium/glutamate symporter  47.59 
 
 
407 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.485218  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0092  sodium/glutamate symporter  47.58 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000111115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000968  sodium/glutamate symporter  48.14 
 
 
361 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2697  sodium/glutamate symporter  45.64 
 
 
407 aa  308  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  36.97 
 
 
409 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2643  sodium/glutamate symporter  43.32 
 
 
402 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1451  sodium/glutamate symporter  35.32 
 
 
414 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1355  sodium-glutamate symporter  35.24 
 
 
409 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0831  sodium/glutamate symporter  39.85 
 
 
402 aa  255  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  37.81 
 
 
402 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  37 
 
 
400 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2504  sodium/glutamate symporter  36.93 
 
 
398 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  39.24 
 
 
402 aa  246  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  39.24 
 
 
402 aa  246  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0496  sodium/glutamate symporter  35.2 
 
 
392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1261  sodium/glutamate symporter  40.72 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4118  hypothetical protein  37.09 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.601595  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1050  sodium/glutamate symporter  37.69 
 
 
398 aa  236  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0733546 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0244  sodium/glutamate symporter  35.62 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0361  transporter, putative  32.22 
 
 
457 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000537763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1953  sodium/glutamate symporter  40.36 
 
 
404 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00992782  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  33.17 
 
 
414 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4810  sodium/glutamate symporter  38.4 
 
 
399 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3454  sodium/glutamate symporter  35.18 
 
 
401 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890755  normal  0.830149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23160  sodium/glutamate symporter  40.15 
 
 
404 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000099413 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  27.19 
 
 
471 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  26.67 
 
 
470 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  23.33 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  25.32 
 
 
471 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  22.73 
 
 
443 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  28.21 
 
 
461 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  21.59 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  25 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>