More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0027 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00584  response regulator  70.09 
 
 
467 aa  666  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3427  response regulator receiver protein  71.03 
 
 
470 aa  660  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0258  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.32 
 
 
469 aa  664  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1328  hitchhiker  1.93209e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  90 
 
 
469 aa  867  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0320  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.82 
 
 
470 aa  667  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0257  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.32 
 
 
471 aa  661  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0266  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.75 
 
 
470 aa  669  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1028  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.11 
 
 
468 aa  655  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.070914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
469 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3458  nitrogen regulation protein NR(I)  68.31 
 
 
466 aa  636  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00165612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
469 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
469 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0499  response regulator receiver domain-containing protein  68.09 
 
 
473 aa  650  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.021061  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01588  two-component system, response regulator  69.03 
 
 
464 aa  653  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
469 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
469 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
472 aa  869  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4651  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  69.59 
 
 
469 aa  652  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.446316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0415  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  69.46 
 
 
478 aa  639  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.855382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0266  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.75 
 
 
470 aa  669  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.649687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
469 aa  868  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0258  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.97 
 
 
470 aa  670  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4923  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  69.25 
 
 
478 aa  638  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924842  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
469 aa  869  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0282  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  70.43 
 
 
471 aa  658  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.675957  hitchhiker  4.21571e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  93.4 
 
 
470 aa  903  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  3.22182e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  100 
 
 
470 aa  959  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5101  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  69.25 
 
 
478 aa  639  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  99.57 
 
 
470 aa  955  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2321  nitrogen regulation protein NR(I)  71.95 
 
 
468 aa  678  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0371  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  71.18 
 
 
470 aa  667  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4098  nitrogen regulation protein NR(I)  92.14 
 
 
470 aa  882  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
469 aa  869  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  90.21 
 
 
472 aa  869  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3561  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.24 
 
 
469 aa  660  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  99.79 
 
 
470 aa  956  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0261  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  70.75 
 
 
470 aa  669  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  90 
 
 
469 aa  867  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  90.21 
 
 
469 aa  869  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  90.85 
 
 
470 aa  876  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4472  nitrogen regulation protein NR(I)  70.11 
 
 
471 aa  662  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  91.49 
 
 
470 aa  880  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5048  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  69.25 
 
 
478 aa  638  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  92.77 
 
 
470 aa  894  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0339  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  68.88 
 
 
478 aa  637  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  92.55 
 
 
470 aa  892  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4822  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  68.45 
 
 
478 aa  636  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  70.51 
 
 
467 aa  671  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3764  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.32 
 
 
471 aa  661  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  90 
 
 
469 aa  867  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0352  nitrogen regulation protein NR(I)  68.45 
 
 
478 aa  636  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3930  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  69.46 
 
 
469 aa  631  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000245107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5859  two-component response regulator NtrC  68.95 
 
 
476 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45900  nitrogen regulation protein, sigma 54-dependent response regulator NtrC (NR(I))  67.67 
 
 
478 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67680  two-component response regulator NtrC  68.95 
 
 
476 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000437551  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4144  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  69.31 
 
 
477 aa  631  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3262  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  67.53 
 
 
471 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0397  nitrogen regulation protein NR(I)  65.58 
 
 
466 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0766  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  66.09 
 
 
477 aa  624  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0246  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  67.53 
 
 
469 aa  622  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.487777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0016  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  65.59 
 
 
468 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0855054  normal  0.786337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0734  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  64.53 
 
 
477 aa  608  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3488  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  64.15 
 
 
466 aa  603  1e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.0666939 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1215  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  65.1 
 
 
471 aa  588  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2541  nitrogen regulation protein NR(I)  62.5 
 
 
470 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0050  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  63.92 
 
 
478 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2901  nitrogen regulation protein NR(I)  62.39 
 
 
468 aa  582  1e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2519  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  62.39 
 
 
468 aa  582  1e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0256  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  63.73 
 
 
490 aa  579  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2500  two component Fis family transcriptional regulator  61.08 
 
 
476 aa  557  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2450  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  61.03 
 
 
462 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000104491  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3651  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  59.96 
 
 
474 aa  545  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.071917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2054  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  55.73 
 
 
524 aa  539  1e-152  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3758  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  59.1 
 
 
476 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2059  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  54.14 
 
 
528 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0914415  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1717  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  51.58 
 
 
570 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1261  nitrogen assimilation regulatory response regulator transcription regulator protein  55.64 
 
 
502 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.634694  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1538  response regulator receiver protein  51.65 
 
 
579 aa  531  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.970597  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1192  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  55.53 
 
 
511 aa  525  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616523  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1089  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  55.25 
 
 
502 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1182  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  55.25 
 
 
502 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1124  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  55.78 
 
 
504 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.359877  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1112  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  55.53 
 
 
511 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1253  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  54.56 
 
 
484 aa  522  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000517304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1479  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  54.58 
 
 
504 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492509  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2147  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  55.58 
 
 
504 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2165  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  55.58 
 
 
504 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5930  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  55.58 
 
 
504 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1445  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  52.87 
 
 
549 aa  517  1e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2250  nitrogen regulation protein NR(I)  55.21 
 
 
511 aa  517  1e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1522  nitrogen regulation protein NR(I)  55.21 
 
 
511 aa  517  1e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2688  nitrogen regulation protein NR(I)  55.21 
 
 
511 aa  517  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3069  nitrogen regulation protein NR(I)  55.21 
 
 
511 aa  517  1e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1740  nitrogen regulation protein NR(I)  55.21 
 
 
511 aa  517  1e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5456  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  55.16 
 
 
506 aa  516  1e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1524  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  54.27 
 
 
505 aa  515  1e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437869  normal  0.0359262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2184  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  54.74 
 
 
508 aa  515  1e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.654908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2766  nitrogen regulation protein NR(I)  55.21 
 
 
511 aa  517  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1846  nitrogen regulation protein NR(I)  54.19 
 
 
513 aa  516  1e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2632  nitrogen regulation protein NR(I)  55.21 
 
 
511 aa  517  1e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>