26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0076 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  867    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  32.67 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2404  hypothetical protein  27.15 
 
 		 436 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3380  hypothetical protein  25.82 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.835336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3419  hypothetical protein  25.59 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.80446e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2794  hypothetical protein  25.65 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.128294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1601  hypothetical protein  28.92 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000118956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3236  hypothetical protein  25.84 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133637 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  27.17 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0801  hypothetical protein  26.67 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.887797  hitchhiker  0.00000709779 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  31.88 
 
 		 421 aa  86.7  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1100  hypothetical protein  26.29 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0366334 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1197  hypothetical protein  26.4 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1030  hypothetical protein  29.06 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0399083 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0324  putative terminase B protein  27.32 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1131  putative terminase B protein  27.32 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.815847  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2354  hypothetical protein  23.46 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0577  terminase B protein, putative  26.29 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  25.75 
 
 		 505 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  22.07 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  21.6 
 
 		 527 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0037  Ppx/GppA family phosphatase  22.11 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  25.26 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  20.99 
 
 		 526 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2551  hypothetical protein  24.51 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  24.74 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>