153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0070 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  40.3 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  36.97 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  40.16 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.98 
 
 		 425 aa  85.9  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  35.58 
 
 		 183 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  37.14 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  37.5 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  42.02 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  38.76 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  38.76 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  38.76 
 
 		 452 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  38.76 
 
 		 448 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  34.78 
 
 		 463 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  38.76 
 
 		 448 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  36.22 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  38.71 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  39.66 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  36.5 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  36.5 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  41.05 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.64 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  35.07 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  37.19 
 
 		 684 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  35.71 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  30.43 
 
 		 169 aa  72  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  34.92 
 
 		 436 aa  72  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  40.48 
 
 		 87 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  32.85 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.45 
 
 		 488 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  34.44 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  42.11 
 
 		 77 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  34.67 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  35.96 
 
 		 396 aa  65.5  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  32.43 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  34.17 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  34.71 
 
 		 447 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  36.28 
 
 		 470 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.19 
 
 		 94 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.19 
 
 		 94 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  33.63 
 
 		 441 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  42.11 
 
 		 297 aa  52.4  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  30.5 
 
 		 298 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  33.66 
 
 		 459 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  34.31 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  40.74 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  39.24 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  47.46 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.79 
 
 		 304 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  31.51 
 
 		 304 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  33.93 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 315 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  29.63 
 
 		 321 aa  48.5  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  37.66 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  44 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  44 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  40.85 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  44 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  44 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  44 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  44 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  44 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.58 
 
 		 284 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  35.14 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.67 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.67 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  45.61 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  44 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.67 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  42.67 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.67 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  42.67 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  28.87 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  27.94 
 
 		 298 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3014  ParB family protein  36.71 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  27.94 
 
 		 298 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  27.94 
 
 		 298 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  35.45 
 
 		 311 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  42.62 
 
 		 300 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  40 
 
 		 293 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  40 
 
 		 293 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  42.67 
 
 		 297 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  29.81 
 
 		 184 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  34.21 
 
 		 287 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  34.29 
 
 		 286 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3031  ParB domain protein nuclease  33 
 
 		 411 aa  45.1  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  45 
 
 		 295 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  39.24 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  42.86 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  37.66 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.66 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  37.66 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  37.66 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  45.76 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  37.66 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>