52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0051 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  570  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  37.32 
 
 
270 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  36.65 
 
 
341 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  38.01 
 
 
399 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  37.09 
 
 
462 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  31.71 
 
 
265 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  26.5 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  27.34 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  26.69 
 
 
302 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0044  band 7 protein  26.62 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.42 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  41.76 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  41.76 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  41.76 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.83 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  39.78 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  23.49 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  44.87 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  44.87 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  46.15 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  44.87 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  44.87 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  44.87 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  42.31 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  44.87 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  45.33 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  44.87 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  44.87 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  29.79 
 
 
316 aa  62  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  25.64 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  26.32 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  38.96 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  25.17 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  25.09 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  34.21 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  26.87 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  23.48 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  24.15 
 
 
312 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  32.33 
 
 
292 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  22.85 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  24.06 
 
 
292 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  37.65 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  28 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  23.38 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  23.38 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  28.1 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  24.16 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  22.47 
 
 
318 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  31.54 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  24.83 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  26.45 
 
 
326 aa  42.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  24.16 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>