39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0031 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0031  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  31.71 
 
 
299 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  33.98 
 
 
879 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  33.33 
 
 
902 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  48 
 
 
953 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  37.08 
 
 
879 aa  48.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  33.98 
 
 
879 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  52.63 
 
 
883 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  34.83 
 
 
879 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  32.95 
 
 
875 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  41.67 
 
 
911 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  28.8 
 
 
846 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  32.95 
 
 
879 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  52.78 
 
 
288 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  48.65 
 
 
988 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  48.65 
 
 
956 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  30.23 
 
 
875 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  37.68 
 
 
885 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  42.5 
 
 
349 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  28.21 
 
 
937 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  28.69 
 
 
876 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  51.43 
 
 
288 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  52.94 
 
 
891 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  27.12 
 
 
899 aa  40.8  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf613  5'-3' exonuclease, exo domain of DNA polymerase I  48.65 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  36 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  43.59 
 
 
875 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  40 
 
 
316 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  40 
 
 
316 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  40 
 
 
316 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  50 
 
 
884 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  56.67 
 
 
965 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  27.5 
 
 
934 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  48.65 
 
 
936 aa  40  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  60 
 
 
892 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  46.34 
 
 
866 aa  40  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  46.34 
 
 
866 aa  40  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  26.19 
 
 
930 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  51.61 
 
 
1273 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>