More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3951 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  99.31 
 
 
290 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  76.68 
 
 
278 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  70.82 
 
 
275 aa  417  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  69.4 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  72.56 
 
 
269 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  72.18 
 
 
269 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  72.18 
 
 
267 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  67.86 
 
 
275 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  71.7 
 
 
271 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  71.7 
 
 
271 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  70.83 
 
 
268 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  66.9 
 
 
275 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  70.94 
 
 
271 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  70.94 
 
 
271 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  71.32 
 
 
271 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  70.19 
 
 
291 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  70.57 
 
 
270 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  70.19 
 
 
291 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  70.19 
 
 
291 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  70.19 
 
 
291 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  59.04 
 
 
291 aa  324  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  58.67 
 
 
291 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  57.41 
 
 
291 aa  318  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  55.91 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  56.55 
 
 
280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  56.67 
 
 
291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  54.35 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  54.45 
 
 
291 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  54.09 
 
 
291 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  60 
 
 
291 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  56.46 
 
 
302 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  53.96 
 
 
295 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  55.3 
 
 
298 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 
290 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  54.07 
 
 
293 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  52.96 
 
 
290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  52.48 
 
 
290 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  51.76 
 
 
294 aa  288  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  55.6 
 
 
297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  55.6 
 
 
297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  53.33 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  54.44 
 
 
290 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  51.24 
 
 
299 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  54.41 
 
 
300 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  51.26 
 
 
291 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  51.26 
 
 
291 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  51.26 
 
 
291 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  51.26 
 
 
291 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  51.66 
 
 
339 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  51.66 
 
 
339 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  52.96 
 
 
256 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  50.9 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  50.9 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  51.26 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  52.42 
 
 
292 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  52.42 
 
 
292 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
291 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  49.29 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  49.46 
 
 
291 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  49.46 
 
 
291 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  49.46 
 
 
291 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  51.38 
 
 
291 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  45.42 
 
 
277 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  48.88 
 
 
290 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  46.44 
 
 
270 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  44.44 
 
 
287 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  38.98 
 
 
239 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  33.88 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  38.96 
 
 
242 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  38.96 
 
 
242 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  32.43 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  36.12 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  40.89 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
248 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.48 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.9 
 
 
295 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.84 
 
 
251 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  35.47 
 
 
227 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  31.85 
 
 
248 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
244 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.35 
 
 
291 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 
220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  34.22 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  31.74 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  31.74 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  31.74 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  29.34 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  31.74 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  32.17 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  34.89 
 
 
229 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  35.93 
 
 
223 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  34.89 
 
 
229 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  33.89 
 
 
229 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  32.52 
 
 
254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>