120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3898 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  79.65 
 
 
404 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  79.16 
 
 
404 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  78.91 
 
 
404 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  79.4 
 
 
404 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  76.67 
 
 
403 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  78.66 
 
 
404 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  99.5 
 
 
404 aa  804    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  87.76 
 
 
404 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  78.91 
 
 
404 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  100 
 
 
404 aa  807    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  100 
 
 
404 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  77.23 
 
 
401 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  77.48 
 
 
401 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  77.23 
 
 
401 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  77.23 
 
 
401 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  77.23 
 
 
401 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  78.91 
 
 
404 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  78 
 
 
401 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  78 
 
 
401 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  78.25 
 
 
401 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  78 
 
 
401 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  78 
 
 
401 aa  628  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  77.75 
 
 
401 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  77.75 
 
 
401 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  69.51 
 
 
423 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  58.06 
 
 
406 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  58.1 
 
 
408 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  58.35 
 
 
408 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  44.47 
 
 
402 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  43.72 
 
 
402 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  43.72 
 
 
402 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  43.32 
 
 
405 aa  324  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  47.94 
 
 
415 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  44.13 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  28.21 
 
 
414 aa  104  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.46 
 
 
215 aa  92.8  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.03 
 
 
183 aa  92.8  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
180 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.26 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  42.86 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  42.16 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  42.16 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  41.18 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  41.18 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  41.18 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  41.18 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.18 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.63 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.68 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.79 
 
 
415 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.92 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.53 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.29 
 
 
402 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.11 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.81 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.11 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.39 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.04 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  36.63 
 
 
343 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.17 
 
 
407 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  35.5 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  40 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.3 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  43.01 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.9 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.62 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  30.56 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  29.7 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.77 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  33.58 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  34.93 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.92 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.4 
 
 
330 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.07 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  34.93 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  34.38 
 
 
359 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.33 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  34.38 
 
 
359 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.38 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  36.46 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.46 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  36.19 
 
 
344 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  30.52 
 
 
403 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.05 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  28.4 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.61 
 
 
404 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  28.57 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  30.63 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.91 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  28.25 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  24.67 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
375 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.71 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  28.66 
 
 
418 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.83 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.89 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.77 
 
 
171 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  30.34 
 
 
103 aa  53.1  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2560  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 
370 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.208635 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>