230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3874 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3874  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 345 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0665  tellurium resistance protein  99.71 
 
 		 345 aa  688    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0010291  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3786  tellurite resistance protein  99.42 
 
 		 345 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000358727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1353  tellurium resistance protein TerC  83.14 
 
 		 346 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000658877  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3697  Integral membrane protein TerC  81.79 
 
 		 347 aa  559  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3904  integral membrane protein TerC  75.73 
 
 		 342 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0811  integral membrane protein TerC  70.93 
 
 		 344 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.13057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0943  tellurium resistance protein TerC  70.88 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0271  integral membrane protein TerC  67.57 
 
 		 331 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0890  integral membrane protein TerC  54.12 
 
 		 338 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0625  membrane protein  52.35 
 
 		 334 aa  348  9e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.039209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0691  tellurium resistance protein  47.76 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000269141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  38.46 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  35.62 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  36.09 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  35.19 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  38.01 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  36.16 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  35.78 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  35.78 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  36.48 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  34.5 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  36.96 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  35.37 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  35.86 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  34.94 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  34.71 
 
 		 354 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  35.29 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  35.11 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  35.14 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  35.56 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  36.17 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  36.86 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  36.48 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  37.19 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  33.93 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  34.62 
 
 		 318 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  38.81 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  34.64 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  37.13 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  35.26 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  33.73 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  33.43 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  33.54 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  35.62 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  35.03 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  33.14 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  33.65 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  33.74 
 
 		 305 aa  177  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  34.91 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  33.94 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  35.26 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  32.32 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  33.24 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  35.31 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  33.43 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  33.24 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  33.24 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  35.27 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  34.04 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  34.04 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  36.65 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  34.04 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  34.97 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  34.97 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  38.18 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  36.88 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  34.32 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  33.14 
 
 		 325 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  33.33 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  34.8 
 
 		 313 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  34.81 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  34.85 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  34.39 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  35.52 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  36.49 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  33.43 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  35 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  31.67 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  35.48 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  35.48 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  35.48 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  34.35 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  35.04 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  34.35 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  34.08 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  34.25 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  35.35 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  33.96 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  34.04 
 
 		 328 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  33.23 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  33.76 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  33.89 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  35.48 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  32.84 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  35.06 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  33.94 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  33 
 
 		 327 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  35.03 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>