234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3766 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3766  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
372 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3621  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
337 aa  693    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3966  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
372 aa  770    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0464  fructose-1,6-bisphosphatase  93.11 
 
 
334 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000776402  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0542  fructose-1,6-bisphosphatase  89.49 
 
 
334 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0499  fructose-1,6-bisphosphatase  89.19 
 
 
334 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3714  fructose-1,6-bisphosphatase  88.59 
 
 
334 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.213043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3912  fructose-1,6-bisphosphatase  88.89 
 
 
334 aa  616  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.166278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04064  hypothetical protein  84.38 
 
 
332 aa  577  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04100  fructose-1,6-bisphosphatase  84.38 
 
 
332 aa  577  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3762  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  84.38 
 
 
332 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4709  fructose-1,6-bisphosphatase  84.38 
 
 
332 aa  577  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4852  fructose-1,6-bisphosphatase  84.38 
 
 
332 aa  577  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3779  fructose-1,6-bisphosphatase  84.38 
 
 
332 aa  577  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4485  fructose-1,6-bisphosphatase  84.38 
 
 
332 aa  577  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4801  fructose-1,6-bisphosphatase  84.38 
 
 
332 aa  577  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4835  fructose-1,6-bisphosphatase  83.78 
 
 
332 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469676  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4780  fructose-1,6-bisphosphatase  83.78 
 
 
332 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.507525  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5751  fructose-1,6-bisphosphatase  84.08 
 
 
332 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4814  fructose-1,6-bisphosphatase  83.78 
 
 
332 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4695  fructose-1,6-bisphosphatase  83.78 
 
 
332 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4684  fructose-1,6-bisphosphatase  83.78 
 
 
332 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0418  fructose-1,6-bisphosphatase  83.48 
 
 
332 aa  571  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2122  fructose-1,6-bisphosphatase  74.47 
 
 
336 aa  524  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001689  fructose-1,6-bisphosphatase type I  73.43 
 
 
338 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00785  fructose-1,6-bisphosphatase  73.78 
 
 
338 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0346  fructose-1,6-bisphosphatase  72.07 
 
 
336 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.696166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1248  fructose-1,6-bisphosphatase  71.34 
 
 
335 aa  508  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3555  fructose-1,6-bisphosphatase  69.94 
 
 
337 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0533  fructose-1,6-bisphosphatase  65.65 
 
 
334 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02300  fructose-1,6-bisphosphatase  64.16 
 
 
339 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1040  fructose-1,6-bisphosphatase  65.88 
 
 
341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.992157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2970  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  63.58 
 
 
361 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1216  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  58.9 
 
 
345 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.696792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2896  D-fructose 1,6-bisphosphatase  57.01 
 
 
346 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00135838  normal  0.0771148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4096  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  58.88 
 
 
331 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0461  fructose-1,6-bisphosphatase  56.92 
 
 
333 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0602  fructose-1,6-bisphosphatase  56.31 
 
 
333 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0557  fructose-1,6-bisphosphatase  57.19 
 
 
332 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0686  fructose-1,6-bisphosphatase  56.62 
 
 
332 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00984781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1243  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  57.19 
 
 
333 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0340688  normal  0.0302273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2207  fructose-1,6-bisphosphatase  55.38 
 
 
333 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000233148  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1674  fructose-1,6-bisphosphatase  54.77 
 
 
332 aa  363  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000201501  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1796  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
333 aa  358  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.88086  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3065  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  49.84 
 
 
334 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740891  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1136  fructose-1,6-bisphosphatase  49.7 
 
 
338 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510745  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0404  fructose-1,6-bisphosphatase  51.08 
 
 
337 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1197  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
337 aa  319  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0711065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2069  fructose-1,6-bisphosphatase  50.15 
 
 
338 aa  315  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1321  fructose-1,6-bisphosphatase  49.24 
 
 
337 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0332934  hitchhiker  0.00400936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0098  Fructose-bisphosphatase  61.89 
 
 
330 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0023  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.94 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.210446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1910  fructose-1,6-bisphosphatase  50.93 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0900171  normal  0.235254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1680  fructose-1,6-bisphosphatase  44.83 
 
 
349 aa  300  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0370  hypothetical protein  45.2 
 
 
331 aa  300  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.351223 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00470  fructose-bisphosphatase, putative  47.02 
 
 
350 aa  293  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30353  predicted protein  46.71 
 
 
380 aa  293  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.66538  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0441  fructose-1,6-bisphosphatase  44.14 
 
 
347 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014948  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1496  fructose-1,6-bisphosphatase  44.67 
 
 
349 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  48 
 
 
336 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0430  fructose-1,6-bisphosphatase  44.14 
 
 
347 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1089  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  43.97 
 
 
358 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2335  fructose-1,6-bisphosphatase  45.13 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0368  fructose-1,6-bisphosphatase  46.75 
 
 
339 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244889  normal  0.233864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0189  fructose-1,6-bisphosphatase  46.75 
 
 
339 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0682  fructose-1,6-bisphosphatase  44.97 
 
 
354 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  45.03 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3429  fructose-1,6-bisphosphatase  44.38 
 
 
349 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169976  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  46.44 
 
 
338 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  44.82 
 
 
337 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  46.13 
 
 
338 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  46.75 
 
 
339 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  46.36 
 
 
337 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  46.13 
 
 
338 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  46.13 
 
 
338 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  45.82 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  45.43 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  0.00000000837949 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51462  Fructose-1,6-bisphosphatase  44.89 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  44.89 
 
 
341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  43.28 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  45.07 
 
 
336 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  45.51 
 
 
335 aa  272  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  44.89 
 
 
338 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  44.11 
 
 
336 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.89 
 
 
334 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000101477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  45.18 
 
 
336 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  44.11 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  44.11 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  44.14 
 
 
337 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  44.55 
 
 
333 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  43.9 
 
 
337 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  44.58 
 
 
337 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  43.81 
 
 
336 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  44.17 
 
 
339 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  44.89 
 
 
338 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  43.6 
 
 
337 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  43.6 
 
 
337 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  45.87 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  43.2 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>