44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3671 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  88.15 
 
 		 428 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  59.48 
 
 		 436 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  43.68 
 
 		 429 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  90.65 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  43.31 
 
 		 428 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  41.38 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  41.11 
 
 		 424 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  40.15 
 
 		 418 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  37.31 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  39.13 
 
 		 431 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  34.98 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  38.17 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  38.06 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  32.31 
 
 		 428 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  30.27 
 
 		 416 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  32.44 
 
 		 443 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  31.54 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  31.95 
 
 		 445 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  30.95 
 
 		 453 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  31.74 
 
 		 429 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  32.11 
 
 		 426 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  28.57 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.55 
 
 		 423 aa  68.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  31.14 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  26.75 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.19 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.48 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  25.9 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  28.95 
 
 		 687 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  22.84 
 
 		 514 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.93 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  36 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  21.59 
 
 		 498 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.23 
 
 		 398 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  29.61 
 
 		 393 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.8 
 
 		 431 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  23.25 
 
 		 430 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.53 
 
 		 411 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2839  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  26.38 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  22.33 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.816052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  30.26 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0026  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.54 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.579056  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.328083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>