More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3647 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  99.74 
 
 
387 aa  798    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  99.48 
 
 
387 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  100 
 
 
397 aa  822    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  59.52 
 
 
389 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  60.11 
 
 
361 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  49.57 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.86 
 
 
356 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.98 
 
 
356 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.98 
 
 
356 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.98 
 
 
356 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.98 
 
 
356 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.86 
 
 
352 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  40.99 
 
 
356 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.57 
 
 
352 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.57 
 
 
352 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.57 
 
 
352 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.28 
 
 
352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  41.12 
 
 
340 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  40.83 
 
 
340 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  40.83 
 
 
340 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  37.75 
 
 
361 aa  222  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  38.73 
 
 
356 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  35.31 
 
 
361 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  38.14 
 
 
367 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.76 
 
 
367 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  32.19 
 
 
352 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.46 
 
 
390 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.23 
 
 
356 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.46 
 
 
394 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.13 
 
 
458 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.46 
 
 
390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.46 
 
 
390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.46 
 
 
390 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.46 
 
 
390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.46 
 
 
390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  30.19 
 
 
370 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.12 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.64 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  32.57 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
475 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
404 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
392 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.07 
 
 
348 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0391  glycosyl transferase family 9  27.78 
 
 
359 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0900723  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.07 
 
 
359 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.38 
 
 
516 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.93 
 
 
360 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  26.26 
 
 
344 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.76 
 
 
359 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
361 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  28.52 
 
 
369 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
347 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
357 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  27.56 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.57 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  26.7 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.95 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  23.62 
 
 
330 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  23.1 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
386 aa  93.2  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
357 aa  93.6  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.45 
 
 
340 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
302 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.29 
 
 
339 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.39 
 
 
779 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  27.21 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.9 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  25.16 
 
 
326 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
379 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  25.96 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.94 
 
 
350 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  25.76 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 
358 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.52 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  24.72 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.12 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.31 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.07 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25.21 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  34.39 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.88 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.88 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.86 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.88 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.88 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.87 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>