267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3578 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 160 aa  333  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 160 aa  333  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 160 aa  333  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  87.5 
 
 		 160 aa  295  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  81.25 
 
 		 165 aa  280  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  81.13 
 
 		 159 aa  280  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  81.13 
 
 		 159 aa  280  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  81.13 
 
 		 159 aa  280  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  81.13 
 
 		 159 aa  280  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  81.13 
 
 		 159 aa  280  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  80.5 
 
 		 196 aa  279  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  80.5 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 		 196 aa  279  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  80.5 
 
 		 196 aa  278  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  79.87 
 
 		 159 aa  278  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  79.87 
 
 		 159 aa  277  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  81.25 
 
 		 160 aa  276  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  80 
 
 		 160 aa  274  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  80 
 
 		 160 aa  269  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  58.13 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  57.5 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0561  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  54.66 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 170 aa  177  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 161 aa  173  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  52.38 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  53.59 
 
 		 160 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  49.43 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  50.91 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  53.42 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  57.86 
 
 		 160 aa  163  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  50.98 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  57.14 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  51.63 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 169 aa  157  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  51.63 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  55.71 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  50.98 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  56.3 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  53.57 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  56.34 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 176 aa  150  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  56.34 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 171 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  55.63 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  55.63 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  44.03 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 171 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 171 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  43.56 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 172 aa  137  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>