82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3344 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 		 451 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 452 aa  930    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  73.09 
 
 		 451 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  73.09 
 
 		 451 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  72.16 
 
 		 451 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  82.6 
 
 		 451 aa  755    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  930    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  930    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  73.09 
 
 		 451 aa  664    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  73.09 
 
 		 451 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  72.39 
 
 		 451 aa  658    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 		 451 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 		 451 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 		 451 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  72.45 
 
 		 451 aa  655    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 		 451 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  73.09 
 
 		 451 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  73.09 
 
 		 451 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  72.69 
 
 		 451 aa  658    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  71.3 
 
 		 451 aa  651    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  73.09 
 
 		 451 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 		 451 aa  663    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  70.6 
 
 		 451 aa  633  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  58.28 
 
 		 453 aa  541  1e-153  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  50.76 
 
 		 455 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  53.45 
 
 		 477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  51.59 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  50.45 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  50.23 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  50.23 
 
 		 450 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  48.31 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  50.66 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  49.78 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  49.64 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  49.32 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  48.6 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  49.41 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  48 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  48.24 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  48.24 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  48.71 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  49.41 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  49.41 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  49.77 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  45.52 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  46.71 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  48.71 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  46.83 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  47.63 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  45.66 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  41.47 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  45.43 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  46.26 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  45.8 
 
 		 442 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  23.81 
 
 		 543 aa  80.1  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.63 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  28.82 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  25.13 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  22.68 
 
 		 505 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.6 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.83 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.62 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  21.43 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  23.34 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  23.34 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  23.34 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  23.34 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  23.34 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  24.68 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.28 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  24.16 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.4 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  21.48 
 
 		 476 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  21.48 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  21.48 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  21.48 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  21.48 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  24.24 
 
 		 396 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.48 
 
 		 493 aa  43.5  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  21.48 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  22.74 
 
 		 519 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>