More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3225 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  100 
 
 
273 aa  567  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  100 
 
 
273 aa  567  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  99.63 
 
 
273 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  62.41 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  57.35 
 
 
272 aa  318  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  57.35 
 
 
272 aa  317  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  57.35 
 
 
272 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  57.35 
 
 
272 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  57.35 
 
 
272 aa  317  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  57.35 
 
 
272 aa  317  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  57.35 
 
 
272 aa  317  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  57.35 
 
 
272 aa  317  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  55.51 
 
 
272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  55.15 
 
 
272 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  55.15 
 
 
272 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  55.15 
 
 
272 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  54.78 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  55.15 
 
 
272 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  55.82 
 
 
255 aa  285  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  38.11 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  38.26 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  37.12 
 
 
265 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  35.98 
 
 
266 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  36.4 
 
 
291 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  34.59 
 
 
273 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  36.5 
 
 
266 aa  168  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  36.5 
 
 
266 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  36.5 
 
 
266 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  36.5 
 
 
266 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  36.5 
 
 
266 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  36.5 
 
 
266 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  36.5 
 
 
266 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  37.26 
 
 
266 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  35.5 
 
 
273 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  36.5 
 
 
266 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  36.5 
 
 
266 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  34.83 
 
 
273 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  35.11 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  35.25 
 
 
280 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
273 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  35.56 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  36.5 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  35.63 
 
 
266 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  35.63 
 
 
266 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  33.85 
 
 
272 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  35.21 
 
 
273 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  34.98 
 
 
266 aa  158  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  34.46 
 
 
274 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  34.46 
 
 
274 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  34.46 
 
 
274 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  36.15 
 
 
266 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  35 
 
 
269 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  34.08 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  34.08 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  35.63 
 
 
269 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  32.71 
 
 
274 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  35.63 
 
 
269 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  34.18 
 
 
273 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  32.46 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  31.56 
 
 
263 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  31.15 
 
 
266 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  30.48 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  29.43 
 
 
269 aa  122  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  27.45 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.22 
 
 
267 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.49 
 
 
293 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.92 
 
 
279 aa  99  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  28.52 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.07 
 
 
274 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.1 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 
271 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  28.25 
 
 
271 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  26.97 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  23.95 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  29.21 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.57 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  26.22 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  28.14 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  28.05 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.21 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  29.21 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  27.51 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  26.75 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.23 
 
 
265 aa  85.9  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 
269 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  28.4 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  28.4 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.57 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  27.24 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  23.77 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  26.2 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  26.34 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.34 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  26.34 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  26.75 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>