90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3163 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  300  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  300  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  100 
 
 		 149 aa  300  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  64.71 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  61.74 
 
 		 151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  62.42 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  58.28 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  58.28 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  58.28 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  58.28 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  58.67 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  58.67 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  57.62 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  58.9 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  58 
 
 		 152 aa  153  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  58 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  61.15 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  57.05 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  58 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  58 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  58 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  58 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  58 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  38.3 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  43.8 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  34.75 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  34.72 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  35.25 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  39.72 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  36.62 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  37.32 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  39.6 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  36.88 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  35.21 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  30.71 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  38.69 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  33.1 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  32.23 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  31.43 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  32.17 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  37.25 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  32.62 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  34.04 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  37.8 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  32.88 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  30.56 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  34.4 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.21 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  34.56 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  32.64 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  28.28 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  31.85 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  31.43 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  27.78 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  33.58 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  28.37 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  26.87 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  29.45 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  26.95 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  27.59 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  26.95 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  26.76 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  25.37 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  26.06 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  24.16 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  30.6 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  29.45 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0690  protein of unknown function DUF107  23.74 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  23.91 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  23.68 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  29.29 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>