31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3094 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  96.55 
 
 		 1067 aa  694    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  46.64 
 
 		 1061 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1092 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  32.37 
 
 		 1051 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  31.72 
 
 		 1101 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1100 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  34.63 
 
 		 1059 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  43.44 
 
 		 2007 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  42.61 
 
 		 1341 aa  99.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  25 
 
 		 1133 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  41.74 
 
 		 1816 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  42.74 
 
 		 1194 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.94 
 
 		 1221 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  32.99 
 
 		 1093 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  32.99 
 
 		 1093 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  31.1 
 
 		 1219 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  35.9 
 
 		 1188 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1830 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  30.27 
 
 		 1543 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  37.14 
 
 		 1057 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1157 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1158 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1159 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1158 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1159 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  25.57 
 
 		 881 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  25.69 
 
 		 837 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1159 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  25 
 
 		 1012 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  25.54 
 
 		 1159 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>