More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3043 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  100 
 
 		 342 aa  666    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 342 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 342 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  87.79 
 
 		 346 aa  584  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  87.65 
 
 		 343 aa  567  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  87.94 
 
 		 343 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  46.95 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  47.88 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 		 835 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  45.08 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  44.73 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.76 
 
 		 310 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  45.97 
 
 		 342 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  45.97 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  45.97 
 
 		 334 aa  241  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.09 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  43.53 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  43.95 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 311 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  42.73 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  43.53 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  45.95 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  45.19 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  45.34 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  45.34 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  45.34 
 
 		 311 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  46.96 
 
 		 322 aa  232  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  46.3 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  45.02 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  44.05 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  44.69 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  44.69 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  45.89 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  45.02 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  42.56 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  42.22 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  42.3 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  42.99 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  43.83 
 
 		 322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.51 
 
 		 317 aa  222  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  45.02 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  45.02 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  42.48 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  45.02 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  45.02 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  45.02 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  45.34 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  45.34 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  45.34 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  45.34 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  45.34 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  45.34 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  45.34 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  45.34 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  45.34 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  42.17 
 
 		 321 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.95 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  42.99 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 341 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.78 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  38.6 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  39.81 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  38.29 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.82 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.82 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  42.23 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  38.29 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  43.18 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  42.59 
 
 		 325 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>