More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3009 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  64.38 
 
 
529 aa  692  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
515 aa  1046  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  71.43 
 
 
509 aa  773  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  69.47 
 
 
509 aa  729  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  66.54 
 
 
512 aa  696  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  65.03 
 
 
508 aa  669  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  66.34 
 
 
511 aa  694  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  64.38 
 
 
529 aa  693  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  64.38 
 
 
529 aa  693  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  65.04 
 
 
512 aa  702  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  65.36 
 
 
512 aa  702  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  64.58 
 
 
529 aa  694  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  64.84 
 
 
512 aa  701  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  64.38 
 
 
529 aa  693  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
515 aa  1046  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
515 aa  1046  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  65.17 
 
 
512 aa  700  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  64.84 
 
 
512 aa  672  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  65.04 
 
 
512 aa  702  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  69.86 
 
 
509 aa  767  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  77.82 
 
 
509 aa  797  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  64.65 
 
 
512 aa  700  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  65.17 
 
 
512 aa  700  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  55.97 
 
 
506 aa  597  1e-169  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  49.18 
 
 
501 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  49.59 
 
 
506 aa  460  1e-128  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  47.53 
 
 
505 aa  459  1e-128  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  49.27 
 
 
492 aa  460  1e-128  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  44.62 
 
 
510 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  43.43 
 
 
497 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  43.85 
 
 
515 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  2.54581e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  43.9 
 
 
511 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  43.32 
 
 
519 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  42.91 
 
 
504 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  42.38 
 
 
537 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  41.65 
 
 
518 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  43.29 
 
 
541 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  44.53 
 
 
516 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  42.39 
 
 
519 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  44.99 
 
 
511 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  44.94 
 
 
516 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  44.74 
 
 
518 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  41.27 
 
 
524 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  43.55 
 
 
520 aa  361  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  42.37 
 
 
524 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  42.37 
 
 
524 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  41.97 
 
 
524 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  41.77 
 
 
524 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49878e-09 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  39.48 
 
 
532 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  41.7 
 
 
514 aa  338  9e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  42.04 
 
 
507 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  42.35 
 
 
506 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  41.81 
 
 
506 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  41.28 
 
 
505 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  41.08 
 
 
505 aa  321  2e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  41.4 
 
 
505 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  39.8 
 
 
507 aa  315  1e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  40.88 
 
 
505 aa  311  3e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  39.51 
 
 
489 aa  306  5e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  38.66 
 
 
520 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  36.2 
 
 
521 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  38.69 
 
 
479 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  37.05 
 
 
504 aa  296  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  35.49 
 
 
507 aa  293  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  37.35 
 
 
497 aa  293  7e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  36.12 
 
 
521 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  37.55 
 
 
505 aa  285  1e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  37.04 
 
 
500 aa  285  2e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  36.45 
 
 
523 aa  281  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  38.87 
 
 
511 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  37.14 
 
 
524 aa  281  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  37.24 
 
 
524 aa  280  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  38.66 
 
 
511 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09030  apolipoprotein N-acyltransferase  40.99 
 
 
516 aa  276  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36821  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  37.17 
 
 
485 aa  273  4e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  35.1 
 
 
522 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  34.78 
 
 
500 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  36.55 
 
 
503 aa  271  3e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  35.93 
 
 
503 aa  271  3e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0678  apolipoprotein N-acyltransferase  36.76 
 
 
485 aa  270  7e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  35.52 
 
 
523 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  37.58 
 
 
487 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  34.65 
 
 
524 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  34.66 
 
 
509 aa  267  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  33.79 
 
 
505 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  36.67 
 
 
510 aa  261  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  32.78 
 
 
564 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  33.73 
 
 
510 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  33.39 
 
 
567 aa  253  5e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  34.32 
 
 
562 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  31.82 
 
 
488 aa  249  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  33.86 
 
 
562 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  34.25 
 
 
562 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
567 aa  246  5e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  31.66 
 
 
582 aa  243  8e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 
567 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 
567 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0600  apolipoprotein N-acyltransferase  33.46 
 
 
553 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  34.67 
 
 
509 aa  237  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  31.38 
 
 
532 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  8.38838e-07  hitchhiker  2.62387e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>