More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2994 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 
554 aa  1025    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
562 aa  641    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 
554 aa  1025    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 
554 aa  1025    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 
561 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 
554 aa  1025    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
554 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 
567 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 
582 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  80.76 
 
 
556 aa  953    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  68.66 
 
 
556 aa  813    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  73.09 
 
 
556 aa  846    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 
554 aa  1025    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  61.79 
 
 
555 aa  697    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  72.78 
 
 
556 aa  838    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 
569 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
569 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 
551 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
551 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 
556 aa  852    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  72 
 
 
556 aa  840    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 
564 aa  719    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  86.75 
 
 
555 aa  1021    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  71.82 
 
 
556 aa  833    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 
609 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 
570 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 
568 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 
576 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  84.96 
 
 
552 aa  998    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  80.76 
 
 
556 aa  961    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  85.66 
 
 
555 aa  1013    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
596 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 
566 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 
587 aa  685    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
569 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
572 aa  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 
554 aa  1025    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
569 aa  688    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 
553 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 
568 aa  688    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 
555 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  68.42 
 
 
559 aa  792    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 
567 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  71.51 
 
 
556 aa  836    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  99.82 
 
 
555 aa  1160    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 
565 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
569 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 
569 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
576 aa  647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 
554 aa  1025    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  86.75 
 
 
555 aa  1021    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  79.45 
 
 
552 aa  941    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  73.5 
 
 
556 aa  845    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  86.91 
 
 
554 aa  1023    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 
590 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  86.93 
 
 
555 aa  1022    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  86.93 
 
 
555 aa  1022    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  71.74 
 
 
555 aa  832    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  62.57 
 
 
567 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  87.09 
 
 
554 aa  1025    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  71.92 
 
 
556 aa  830    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 
705 aa  641    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  73.87 
 
 
571 aa  854    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  58.71 
 
 
558 aa  674    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  60 
 
 
576 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
561 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
558 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
569 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 
565 aa  713    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 
582 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0094  glutaminyl-tRNA synthetase  67.21 
 
 
556 aa  795    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  67.45 
 
 
553 aa  800    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 
567 aa  719    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
569 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  86.55 
 
 
554 aa  1021    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 
557 aa  682    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  73.87 
 
 
558 aa  872    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
569 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
552 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
552 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  76.36 
 
 
548 aa  882    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  75.41 
 
 
555 aa  859    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  72.78 
 
 
556 aa  840    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  72.96 
 
 
556 aa  841    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  72.83 
 
 
556 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 
589 aa  658    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 
569 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
569 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  60.4 
 
 
556 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  73.87 
 
 
556 aa  852    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  86.93 
 
 
555 aa  1022    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
569 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
564 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
555 aa  1162    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  73.32 
 
 
556 aa  845    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 
580 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 
565 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  99.82 
 
 
555 aa  1160    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 
556 aa  852    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 
559 aa  677    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>