More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2844 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.41 
 
 
933 aa  1107    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  58.8 
 
 
949 aa  1133    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.9 
 
 
949 aa  1132    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.37 
 
 
934 aa  1043    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  99.89 
 
 
949 aa  1951    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  59.37 
 
 
949 aa  1122    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.69 
 
 
949 aa  1132    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.69 
 
 
949 aa  1131    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.8 
 
 
949 aa  1134    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.94 
 
 
948 aa  1115    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.94 
 
 
948 aa  1115    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  58.41 
 
 
933 aa  1107    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.04 
 
 
948 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  99.79 
 
 
949 aa  1949    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.91 
 
 
915 aa  1083    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.04 
 
 
948 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.95 
 
 
955 aa  1085    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  100 
 
 
957 aa  1970    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.8 
 
 
949 aa  1134    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  60.44 
 
 
951 aa  1149    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  60.61 
 
 
951 aa  1157    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  71.11 
 
 
957 aa  1362    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.9 
 
 
949 aa  1136    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
936 aa  349  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1074 aa  342  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  33.09 
 
 
936 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
925 aa  336  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  32.78 
 
 
1083 aa  310  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  32.76 
 
 
1084 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  31.33 
 
 
1122 aa  301  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  32.84 
 
 
1053 aa  297  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1070 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  32.45 
 
 
774 aa  289  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  36.5 
 
 
951 aa  281  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4270  histidine kinase  28.68 
 
 
1175 aa  273  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  35.62 
 
 
935 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
1001 aa  265  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
1002 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  35.1 
 
 
1064 aa  259  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1029 aa  259  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1202 aa  259  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
1022 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
909 aa  255  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.67 
 
 
1129 aa  255  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
1003 aa  253  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 
1765 aa  250  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  28.8 
 
 
1098 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  28.45 
 
 
1082 aa  245  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  28.45 
 
 
1082 aa  245  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
1082 aa  245  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  30.61 
 
 
1014 aa  244  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
1436 aa  244  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0907  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
919 aa  244  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.651038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.59 
 
 
1763 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  36.15 
 
 
931 aa  243  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  33.8 
 
 
785 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
1032 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
1418 aa  243  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  33.73 
 
 
785 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  33.8 
 
 
785 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.57 
 
 
927 aa  241  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3080  histidine kinase  38.78 
 
 
1088 aa  240  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169759  normal  0.77184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
1768 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  33.78 
 
 
1309 aa  240  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  33.52 
 
 
727 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
1237 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  31.78 
 
 
2035 aa  238  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
1788 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  30.25 
 
 
1068 aa  238  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
787 aa  238  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  33.53 
 
 
779 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
1436 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  33.27 
 
 
785 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  33.77 
 
 
942 aa  237  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  29.17 
 
 
1322 aa  236  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  32.76 
 
 
778 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
1314 aa  236  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  34.29 
 
 
1014 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
1042 aa  235  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.73 
 
 
1765 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1305 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  34.29 
 
 
988 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  34.29 
 
 
1032 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1767 aa  234  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  32.77 
 
 
891 aa  234  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1771 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1767 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  33.46 
 
 
786 aa  233  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.6 
 
 
772 aa  233  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  33.02 
 
 
1030 aa  233  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4626  two-component regulatory system sensor kinase  31.94 
 
 
983 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185559  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  32.06 
 
 
737 aa  233  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1005 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
1002 aa  232  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
758 aa  231  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1032 aa  231  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  35.21 
 
 
952 aa  231  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1490 aa  230  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1767 aa  230  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
916 aa  230  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>