171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2798 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  63.33 
 
 
586 aa  792    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  63.33 
 
 
586 aa  792    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  63.33 
 
 
586 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  63.33 
 
 
586 aa  792    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  63.17 
 
 
586 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  65.61 
 
 
582 aa  801    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  62.71 
 
 
590 aa  775    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  63 
 
 
586 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  63.55 
 
 
590 aa  780    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  63.33 
 
 
586 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  63.33 
 
 
586 aa  792    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  63.33 
 
 
586 aa  791    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  63.33 
 
 
586 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  62.77 
 
 
586 aa  793    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  100 
 
 
598 aa  1224    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  63.33 
 
 
586 aa  792    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  63.33 
 
 
586 aa  792    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  75.59 
 
 
593 aa  933    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  100 
 
 
598 aa  1224    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  100 
 
 
598 aa  1224    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  63.33 
 
 
586 aa  792    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  63.33 
 
 
586 aa  792    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  64.55 
 
 
582 aa  791    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  41.47 
 
 
601 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  42.57 
 
 
602 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  42.9 
 
 
602 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  41.89 
 
 
600 aa  519  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  39.23 
 
 
580 aa  472  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  34.38 
 
 
595 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  32.18 
 
 
595 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  31.92 
 
 
595 aa  310  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  31.7 
 
 
596 aa  309  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  30.71 
 
 
604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  30.77 
 
 
595 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  30.93 
 
 
595 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  30.93 
 
 
595 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  30.63 
 
 
596 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.63 
 
 
596 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  31 
 
 
592 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  30.77 
 
 
595 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  30.63 
 
 
596 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  30.38 
 
 
594 aa  297  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  30.06 
 
 
594 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  29.32 
 
 
596 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  29.23 
 
 
613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  28.62 
 
 
609 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  31.07 
 
 
594 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  26.72 
 
 
617 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  26.72 
 
 
617 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  26.6 
 
 
637 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  26.6 
 
 
637 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  25.74 
 
 
622 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  29.52 
 
 
607 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  26.63 
 
 
607 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  27.45 
 
 
615 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  27.12 
 
 
611 aa  197  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  26.06 
 
 
600 aa  188  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  26.53 
 
 
625 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  25.78 
 
 
638 aa  183  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  25.84 
 
 
586 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.75 
 
 
647 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  28.11 
 
 
624 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  23.68 
 
 
509 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  29.31 
 
 
642 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  28.43 
 
 
641 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  26.1 
 
 
638 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  26.1 
 
 
635 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  27.94 
 
 
508 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  26.78 
 
 
614 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  21.4 
 
 
630 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  25.82 
 
 
621 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  24.51 
 
 
621 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  24.51 
 
 
621 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  28.57 
 
 
495 aa  59.3  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  28.57 
 
 
495 aa  59.3  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  37.5 
 
 
508 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  37.63 
 
 
517 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  37.63 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.21 
 
 
500 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  37.63 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  37.63 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  37.63 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  37.63 
 
 
517 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  37.63 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3501  sulfatase  33.62 
 
 
598 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  36.56 
 
 
517 aa  54.7  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  29.91 
 
 
489 aa  53.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  21.9 
 
 
784 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  33.33 
 
 
513 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4712  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
600 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0528  sulfatase  32.65 
 
 
487 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  26.57 
 
 
1009 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  25.83 
 
 
500 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  31.91 
 
 
1065 aa  50.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  35.48 
 
 
515 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  31.17 
 
 
476 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  34.41 
 
 
516 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0351  sulfatase  35.8 
 
 
419 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  29.27 
 
 
628 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  34.41 
 
 
516 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>