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for query gene YPK_2792 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  100 
 
 
401 aa  803    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  82.83 
 
 
402 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  99.24 
 
 
399 aa  782    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  99.49 
 
 
399 aa  784    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  76.4 
 
 
396 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  78.06 
 
 
396 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  73.72 
 
 
393 aa  586  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  73.03 
 
 
398 aa  567  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  73.21 
 
 
398 aa  571  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.97 
 
 
396 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.97 
 
 
396 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.47 
 
 
396 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.97 
 
 
396 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.97 
 
 
396 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.97 
 
 
396 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.47 
 
 
396 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.21 
 
 
396 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  69.21 
 
 
396 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.21 
 
 
396 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  69.21 
 
 
396 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.21 
 
 
396 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.21 
 
 
396 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  51.83 
 
 
401 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  46.7 
 
 
395 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  50 
 
 
400 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  50 
 
 
400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  47.06 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  44.04 
 
 
403 aa  322  6e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  43.63 
 
 
370 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.81 
 
 
397 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  35.58 
 
 
426 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  37.5 
 
 
414 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  34.79 
 
 
420 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  37.7 
 
 
426 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.69 
 
 
405 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  37.5 
 
 
402 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.12 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.12 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.82 
 
 
405 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.52 
 
 
434 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.52 
 
 
405 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.52 
 
 
405 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.86 
 
 
407 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.95 
 
 
414 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.16 
 
 
406 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.76 
 
 
411 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.97 
 
 
406 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.73 
 
 
416 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.34 
 
 
424 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.96 
 
 
416 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.29 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 
398 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.79 
 
 
410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.88 
 
 
498 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.96 
 
 
405 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.89 
 
 
420 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.98 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  35.05 
 
 
392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  35.04 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.71 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  36.08 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  34.79 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.88 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.16 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.89 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.88 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.51 
 
 
396 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.06 
 
 
412 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.22 
 
 
399 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 
403 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.68 
 
 
412 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.47 
 
 
412 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.47 
 
 
412 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
400 aa  210  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.31 
 
 
399 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.49 
 
 
400 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.49 
 
 
400 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.49 
 
 
400 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.49 
 
 
400 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.22 
 
 
419 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  36.63 
 
 
404 aa  209  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.25 
 
 
394 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.77 
 
 
394 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.96 
 
 
416 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.22 
 
 
416 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.07 
 
 
392 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.96 
 
 
416 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.96 
 
 
416 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.9 
 
 
416 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.7 
 
 
419 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4611  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  35.31 
 
 
422 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  33.25 
 
 
401 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.7 
 
 
416 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.25 
 
 
398 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.38 
 
 
409 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.53 
 
 
408 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.45 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 
394 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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