More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2658 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  99.62 
 
 		 261 aa  540  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  99.62 
 
 		 261 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  79.69 
 
 		 261 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  72.41 
 
 		 261 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  72.41 
 
 		 261 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  72.83 
 
 		 278 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  68.58 
 
 		 261 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  63.98 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  63.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  63.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  63.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  63.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  63.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  63.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  63.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  63.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  64.71 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  64.17 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  64.17 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  64.17 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  64.17 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  63.78 
 
 		 267 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  48.06 
 
 		 263 aa  265  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  49.05 
 
 		 271 aa  263  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  48.83 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  48.06 
 
 		 263 aa  261  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  48.03 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  44.84 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  44.36 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  42.63 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  42.63 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  41.83 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  41.57 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  41.57 
 
 		 257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  42.41 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  42.06 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  38.91 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  42.63 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  43.46 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  42.57 
 
 		 249 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  42.41 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  44.98 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  42.69 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  44.58 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  44.18 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  42.23 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  37.6 
 
 		 247 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  39 
 
 		 267 aa  174  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  37.84 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  35.98 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  35.85 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  37.05 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  39.55 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  35.03 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  31.06 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  29.92 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  27.2 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  26.15 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  28.63 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.2 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  29.3 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2305  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.43 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.31 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.73 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.35 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00158805  hitchhiker  0.0000000749006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32.67 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  25.35 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.84 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>