118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2468 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  376  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  376  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  376  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  82.7 
 
 
189 aa  311  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  74.21 
 
 
190 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  76.34 
 
 
190 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  74.21 
 
 
190 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  72.58 
 
 
190 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  69.52 
 
 
188 aa  267  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  69.52 
 
 
188 aa  267  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  69.52 
 
 
188 aa  267  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  69.52 
 
 
188 aa  267  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  69.52 
 
 
188 aa  266  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  67.38 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  70.66 
 
 
200 aa  244  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  62.03 
 
 
189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  62.7 
 
 
188 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  60.75 
 
 
190 aa  229  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  60.75 
 
 
189 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  62.64 
 
 
178 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  58.06 
 
 
232 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  52.97 
 
 
185 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  55.32 
 
 
191 aa  187  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  49.2 
 
 
188 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  51.58 
 
 
232 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  52.36 
 
 
196 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  55.91 
 
 
189 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  43.02 
 
 
198 aa  142  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  39.25 
 
 
201 aa  141  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  40 
 
 
189 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  44.5 
 
 
193 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  38.1 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  40.54 
 
 
189 aa  131  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  37.97 
 
 
188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  39.78 
 
 
185 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  39.34 
 
 
187 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  39.34 
 
 
187 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  40 
 
 
186 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  37.29 
 
 
179 aa  125  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  49.74 
 
 
194 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  124  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  40.2 
 
 
213 aa  121  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  41.9 
 
 
194 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  41.18 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  34.44 
 
 
194 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  38.38 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  39.89 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  38.38 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  38.89 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  38.38 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  35.26 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  38.64 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  36.17 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  38.22 
 
 
192 aa  111  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  37.84 
 
 
187 aa  111  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  36.36 
 
 
190 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  37.64 
 
 
184 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  38.64 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  35.56 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  34.64 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  38.38 
 
 
188 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  35.85 
 
 
184 aa  106  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  32.96 
 
 
181 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  39.77 
 
 
181 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  37.57 
 
 
185 aa  104  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  34.57 
 
 
189 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  30.77 
 
 
185 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  36.02 
 
 
189 aa  101  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  33.73 
 
 
186 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  35.68 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  34.57 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  31.84 
 
 
182 aa  98.6  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  33.51 
 
 
193 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  35.76 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  38.79 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  30.27 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  33.86 
 
 
185 aa  94.4  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  31.69 
 
 
188 aa  94.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  36.93 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  31.69 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  31.69 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  31.69 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  34.21 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5416  hypothetical protein  31.69 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  31.69 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  32.79 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000039704  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  30.89 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5024  integral membrane protein  31.69 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120061  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4106  hypothetical protein  52.33 
 
 
94 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  33.53 
 
 
185 aa  87  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5502  hypothetical protein  32.24 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  28.06 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.992365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>