19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2434 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  70.37 
 
 		 108 aa  156  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2346  hypothetical protein  64.81 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000082368  hitchhiker  0.00160333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2114  putative cytoplasmic protein  64.81 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000392621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2233  hypothetical protein  64.81 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0210467  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2169  putative cytoplasmic protein  64.81 
 
 		 108 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000813161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  60.55 
 
 		 170 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  59.63 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  59.82 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1616  hypothetical protein  57.75 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.396977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1790  hypothetical protein  58.06 
 
 		 62 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2748  hypothetical protein  42.59 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0940  protein of unknown function DUF1493  37.78 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.255022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2476  hypothetical protein  27.35 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0239  protein of unknown function DUF1493  40.62 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0109  hypothetical protein  28.44 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4583  hypothetical protein  29.55 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5116  hypothetical protein  29.55 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4587  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>