227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2382 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  100 
 
 
466 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  99.14 
 
 
466 aa  900    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  99.57 
 
 
466 aa  904    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  52.32 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  49.18 
 
 
474 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  48.29 
 
 
467 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  47.98 
 
 
465 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  48.29 
 
 
467 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  48.29 
 
 
467 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  48.19 
 
 
468 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  48.62 
 
 
468 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  49.25 
 
 
465 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  46.67 
 
 
472 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  49.25 
 
 
468 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  49.25 
 
 
468 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  49.25 
 
 
468 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  49.25 
 
 
468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  49.04 
 
 
468 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  47.01 
 
 
471 aa  359  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  43.49 
 
 
499 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  40.13 
 
 
458 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1580  flagellar hook-associated 2 domain protein  47.42 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.9 
 
 
482 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  41.96 
 
 
471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  39.2 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  36.4 
 
 
441 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  38.14 
 
 
445 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.42 
 
 
447 aa  243  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  37.25 
 
 
488 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  36.77 
 
 
487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  36.97 
 
 
498 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  35.5 
 
 
665 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.47 
 
 
502 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  32.71 
 
 
668 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.2 
 
 
505 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  35.61 
 
 
505 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  34.39 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.39 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  34.44 
 
 
669 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  31.39 
 
 
452 aa  171  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.57 
 
 
680 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.57 
 
 
680 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  31.26 
 
 
458 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  33 
 
 
677 aa  166  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.24 
 
 
479 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.91 
 
 
468 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.84 
 
 
451 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.47 
 
 
451 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  32.76 
 
 
685 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.35 
 
 
678 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.35 
 
 
678 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  32.02 
 
 
474 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.77 
 
 
475 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  32.39 
 
 
441 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  32.39 
 
 
441 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.97 
 
 
477 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.01 
 
 
502 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  31.55 
 
 
469 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.19 
 
 
500 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  32.23 
 
 
477 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  30.44 
 
 
487 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  29.7 
 
 
452 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.91 
 
 
472 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.92 
 
 
657 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  30.4 
 
 
456 aa  146  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.89 
 
 
487 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.9 
 
 
452 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.61 
 
 
473 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.44 
 
 
454 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.44 
 
 
454 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.72 
 
 
457 aa  143  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.5 
 
 
475 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  30.22 
 
 
500 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  32.63 
 
 
452 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.5 
 
 
473 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  30.83 
 
 
477 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  30.23 
 
 
513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  30.68 
 
 
495 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.3 
 
 
451 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.77 
 
 
473 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  31.12 
 
 
507 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.75 
 
 
462 aa  136  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  31.12 
 
 
507 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  31.12 
 
 
507 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  30.88 
 
 
692 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.31 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  31.12 
 
 
507 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.86 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  31.12 
 
 
507 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  31.12 
 
 
507 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.76 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  27.1 
 
 
478 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.27 
 
 
453 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  30.91 
 
 
507 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  29.54 
 
 
454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  28.64 
 
 
437 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.24 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4396  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.12 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.446586  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  29.01 
 
 
484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.54 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>