244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2090 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  99.45 
 
 
183 aa  377  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  99.45 
 
 
183 aa  377  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  77.6 
 
 
183 aa  305  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  75.96 
 
 
183 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  74.86 
 
 
183 aa  298  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  72.13 
 
 
183 aa  287  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  72.13 
 
 
183 aa  286  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  66.67 
 
 
183 aa  257  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  66.12 
 
 
183 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  65.57 
 
 
183 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  65.57 
 
 
183 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  66.12 
 
 
183 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  65.03 
 
 
183 aa  254  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  65.03 
 
 
183 aa  254  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  65.03 
 
 
183 aa  254  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  65.03 
 
 
183 aa  254  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  65.03 
 
 
183 aa  254  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  65.03 
 
 
183 aa  254  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  65.03 
 
 
183 aa  254  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  65.03 
 
 
183 aa  254  7e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  65.03 
 
 
183 aa  253  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  63.93 
 
 
183 aa  245  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  60.11 
 
 
182 aa  231  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  59.56 
 
 
182 aa  225  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  55.29 
 
 
183 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  52.46 
 
 
182 aa  193  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  56.59 
 
 
182 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  51.18 
 
 
183 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  48.63 
 
 
182 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  46.99 
 
 
182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  47.54 
 
 
182 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  45.9 
 
 
182 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  45.36 
 
 
182 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  45.9 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  43.48 
 
 
184 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  45.9 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  43.72 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  45.9 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  45.36 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  45.36 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  45.36 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  45.36 
 
 
182 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  44.26 
 
 
182 aa  164  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  42.93 
 
 
186 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  47.83 
 
 
186 aa  157  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  43.78 
 
 
186 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  47.06 
 
 
182 aa  153  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  46.34 
 
 
185 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  45.73 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  45.73 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  44.85 
 
 
186 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  45.29 
 
 
185 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  47.59 
 
 
186 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  40.54 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  44.85 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  42.77 
 
 
188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  42.77 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  40.66 
 
 
191 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  38.64 
 
 
193 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  36.87 
 
 
209 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  36.36 
 
 
194 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  38.89 
 
 
235 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  35.11 
 
 
219 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  36.81 
 
 
208 aa  110  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  38.89 
 
 
196 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  36.46 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  31.82 
 
 
187 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  29.73 
 
 
187 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  36.11 
 
 
207 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  37.29 
 
 
207 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  35.26 
 
 
219 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  34.09 
 
 
187 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  39.26 
 
 
187 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  32.61 
 
 
191 aa  104  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  31.76 
 
 
188 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  34.94 
 
 
195 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  37.42 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  30.9 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  35.52 
 
 
187 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  34.09 
 
 
191 aa  98.2  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  34.09 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  32.24 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  36.59 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  33.54 
 
 
208 aa  97.1  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  35.14 
 
 
216 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  32.93 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  32.95 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  32.45 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  35.52 
 
 
193 aa  95.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  38.04 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  33.11 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  34.57 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  34.41 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>