More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1864 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  100 
 
 
283 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  98.94 
 
 
283 aa  580  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  99.29 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  65.61 
 
 
273 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  52.54 
 
 
283 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  52.84 
 
 
283 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  43.02 
 
 
356 aa  271  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  53.57 
 
 
324 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  51.58 
 
 
275 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  50.53 
 
 
271 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  50.53 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  50.53 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  50.53 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  50.53 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  50.53 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  50.53 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  50.53 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  51.41 
 
 
256 aa  258  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  47.22 
 
 
273 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  47.22 
 
 
273 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  47.22 
 
 
273 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  47.22 
 
 
273 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  47.22 
 
 
273 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  52.2 
 
 
234 aa  185  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  51.57 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  51.57 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  50.94 
 
 
249 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  50.94 
 
 
249 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  50.94 
 
 
208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  51.57 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  50.94 
 
 
257 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  49.06 
 
 
249 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  43.17 
 
 
198 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  45.04 
 
 
177 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  39.86 
 
 
174 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  43.08 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.87 
 
 
205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  42 
 
 
188 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  43.08 
 
 
177 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  41.67 
 
 
181 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 
173 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  41.5 
 
 
234 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  39.29 
 
 
181 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  46.46 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  46.46 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  46.46 
 
 
208 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  46.46 
 
 
208 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
177 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
177 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  40.94 
 
 
179 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  35.33 
 
 
225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  44.63 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  37.96 
 
 
178 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  41.06 
 
 
209 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  42.52 
 
 
209 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  44.8 
 
 
230 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  48.28 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  44.09 
 
 
133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  43.22 
 
 
234 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  43.22 
 
 
234 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  43.22 
 
 
234 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  43.22 
 
 
218 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  43.22 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  43.22 
 
 
218 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  43.22 
 
 
218 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  43.22 
 
 
218 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
183 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  42.19 
 
 
224 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40 
 
 
202 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
248 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  43.97 
 
 
223 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  43.97 
 
 
223 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.1 
 
 
224 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
221 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  44.54 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 
221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  42.24 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  33.33 
 
 
404 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  38.82 
 
 
192 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  43.44 
 
 
220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  43.44 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  38.93 
 
 
169 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  44.44 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  39.34 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  39.13 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  38.2 
 
 
242 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  40.32 
 
 
212 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  39.83 
 
 
382 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  40 
 
 
407 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  40.65 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  40 
 
 
404 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  40 
 
 
407 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  40 
 
 
407 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>