124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1777 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 
176 aa  344  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  99.39 
 
 
163 aa  317  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  99.39 
 
 
163 aa  317  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  60.14 
 
 
167 aa  177  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  41.76 
 
 
171 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  40.59 
 
 
177 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  40 
 
 
333 aa  84.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  36.84 
 
 
167 aa  83.6  1e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  36.69 
 
 
167 aa  81.6  5e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  36.69 
 
 
167 aa  81.3  6e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  40.79 
 
 
325 aa  81.3  7e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  40.88 
 
 
184 aa  77  1e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  40.88 
 
 
184 aa  77  1e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  42.31 
 
 
320 aa  75.9  3e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  38.24 
 
 
318 aa  72.8  2e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  33.71 
 
 
167 aa  72.8  3e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  40.38 
 
 
345 aa  71.6  5e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  40.38 
 
 
336 aa  71.6  5e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  32.94 
 
 
173 aa  71.6  5e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  40.38 
 
 
336 aa  71.2  6e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  37.88 
 
 
182 aa  71.2  7e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  39.42 
 
 
372 aa  70.5  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  37.12 
 
 
182 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  41.35 
 
 
331 aa  69.3  2e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  39.42 
 
 
329 aa  69.7  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  39.42 
 
 
336 aa  70.1  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  41.35 
 
 
331 aa  70.1  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  33.52 
 
 
184 aa  70.1  2e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  39.42 
 
 
336 aa  70.1  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  39.42 
 
 
336 aa  70.1  2e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  36.36 
 
 
344 aa  68.6  5e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  33.33 
 
 
166 aa  67  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.45 
 
 
163 aa  65.5  4e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  31.25 
 
 
160 aa  65.1  5e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  28.24 
 
 
169 aa  64.3  9e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  34.4 
 
 
180 aa  63.5  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  30.77 
 
 
194 aa  63.2  2e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  31.29 
 
 
185 aa  62.8  2e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  32.06 
 
 
124 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  32.2 
 
 
182 aa  63.5  2e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  35.56 
 
 
168 aa  62.8  3e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  35.56 
 
 
168 aa  62.8  3e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  35.56 
 
 
168 aa  62.8  3e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  35.56 
 
 
174 aa  62.4  3e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  35.56 
 
 
168 aa  62.8  3e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  35.56 
 
 
174 aa  62.4  3e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  31.25 
 
 
160 aa  62.8  3e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  33.6 
 
 
182 aa  62  4e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  32.26 
 
 
179 aa  61.2  6e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  36.02 
 
 
182 aa  60.8  9e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  34.18 
 
 
165 aa  60.8  9e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  34.85 
 
 
174 aa  59.7  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  34.55 
 
 
167 aa  58.9  3e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  58.5  4e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  35 
 
 
234 aa  58.5  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  34.06 
 
 
181 aa  58.5  5e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  34.06 
 
 
181 aa  58.2  7e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  40.78 
 
 
185 aa  57.8  8e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  40.78 
 
 
164 aa  57.8  9e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  40.78 
 
 
172 aa  57.8  9e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  40.78 
 
 
164 aa  57.8  9e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  40.78 
 
 
172 aa  57.4  9e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  40.78 
 
 
164 aa  57.8  9e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  30.13 
 
 
339 aa  57.4  1e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  29.29 
 
 
175 aa  56.6  2e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.82 
 
 
156 aa  55.1  5e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  33.54 
 
 
190 aa  55.1  5e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  34.21 
 
 
167 aa  55.1  5e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  38.61 
 
 
174 aa  55.1  5e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
175 aa  55.1  6e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  33.96 
 
 
181 aa  53.9  1e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  29.29 
 
 
197 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  29.38 
 
 
178 aa  53.1  2e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  25.19 
 
 
175 aa  53.1  2e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  38.24 
 
 
170 aa  52.4  3e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  38.24 
 
 
170 aa  52.4  3e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
197 aa  52  4e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  32.81 
 
 
154 aa  51.6  5e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  32.81 
 
 
154 aa  51.6  5e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  34.74 
 
 
170 aa  51.6  6e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  32.09 
 
 
177 aa  51.2  8e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  34.85 
 
 
153 aa  50.1  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  33.33 
 
 
177 aa  48.5  5e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  29.41 
 
 
122 aa  47.8  8e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  35.92 
 
 
172 aa  47.8  9e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  27.97 
 
 
153 aa  47.4  9e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  32.84 
 
 
178 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  32.84 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  27.04 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  29.74 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  31.34 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.82 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  34.72 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  31.31 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  32.08 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  34.72 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  34.72 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  34.72 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  34.72 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  34.72 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>