82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1775 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  99.6 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  56.52 
 
 		 254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  47 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  47 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  46.54 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  46.54 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  46.54 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  47 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  47 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  44.08 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  40.71 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  43.59 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  43.59 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  43.59 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  46.46 
 
 		 279 aa  191  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  44.3 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  42.68 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  42.02 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  40.61 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  38.24 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  37.8 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  36.05 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  35.5 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  32.16 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  32.49 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  30.08 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.7 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  33.33 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  34.93 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  33.97 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  34.45 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  33.68 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  28.21 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  30.04 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  30.04 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  30.04 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  30.04 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  30.04 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  30.04 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  30.04 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  28.38 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  27.19 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  27.19 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  26.86 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  27.34 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  25.56 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  28.1 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  24.38 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  22.4 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  24.45 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  25 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  23.64 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  23.64 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  23.64 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  32.38 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  22.58 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  25.14 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  25.35 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  23.3 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  23.64 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  23.64 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  23.64 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  24.11 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  24.11 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  25.69 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  25.69 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  22.32 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  25.69 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  24.24 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  26.06 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  22.96 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  22.96 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  26.09 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  26.09 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0376  fimbrial chaperone protein  26.35 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.187051  normal  0.269695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  24.44 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.87 
 
 		 250 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  23.72 
 
 		 309 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  28.57 
 
 		 250 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  28.57 
 
 		 250 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>