41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1773 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  99.09 
 
 		 329 aa  644    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  46.98 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  42.14 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  42.14 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  36.53 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  34.73 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  35.57 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  35.57 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  35.18 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  35.18 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  35.18 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  35.18 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  35.18 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  35.18 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  33.94 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  34.77 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  30.61 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  32.73 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  30.61 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  34.44 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  34.67 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  30.74 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  29.1 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  30.17 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  30.17 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.9 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  33.11 
 
 		 181 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  27.59 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  27.57 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  28.22 
 
 		 182 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  30.34 
 
 		 168 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  29.21 
 
 		 336 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  26.09 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  25.4 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>