More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1632 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  100 
 
 
462 aa  965    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  100 
 
 
462 aa  965    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  100 
 
 
462 aa  965    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  61.4 
 
 
470 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  61.61 
 
 
456 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  61.87 
 
 
450 aa  589  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  61.61 
 
 
456 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  61.61 
 
 
456 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  60.52 
 
 
456 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  60.74 
 
 
456 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  60.3 
 
 
456 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  61.66 
 
 
450 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  61.17 
 
 
456 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  60.3 
 
 
457 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  61.39 
 
 
456 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  60.52 
 
 
456 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  60.3 
 
 
456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  60.09 
 
 
456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  62.47 
 
 
457 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  60.52 
 
 
456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  60.22 
 
 
455 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  60.3 
 
 
456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  60.09 
 
 
456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  61.98 
 
 
460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  60.48 
 
 
454 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  61.17 
 
 
457 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  60.3 
 
 
457 aa  578  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  60.74 
 
 
457 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  60.95 
 
 
457 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  60.53 
 
 
456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  59.65 
 
 
453 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  58.82 
 
 
454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  58.71 
 
 
463 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  58.11 
 
 
447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  58.99 
 
 
454 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  57.52 
 
 
450 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  56.64 
 
 
450 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  55.76 
 
 
481 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  55.92 
 
 
461 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  54.41 
 
 
486 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  55.84 
 
 
813 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  53.48 
 
 
486 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  55.77 
 
 
456 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  56.61 
 
 
450 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  56.48 
 
 
453 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  55.58 
 
 
448 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  53.61 
 
 
448 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  56.04 
 
 
453 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  55.7 
 
 
450 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  54.17 
 
 
448 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  52.77 
 
 
487 aa  511  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  55.12 
 
 
449 aa  508  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  53.13 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  52.27 
 
 
457 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  54.68 
 
 
449 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  52.92 
 
 
458 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  51.67 
 
 
497 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  52.11 
 
 
493 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  53.05 
 
 
467 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  50.7 
 
 
493 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  51.41 
 
 
456 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  49.89 
 
 
451 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  48.73 
 
 
473 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  40.22 
 
 
447 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  58.19 
 
 
282 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  38.99 
 
 
446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  39.5 
 
 
448 aa  335  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  39.5 
 
 
448 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  37.96 
 
 
456 aa  319  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  37.5 
 
 
472 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  37.44 
 
 
453 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  38.63 
 
 
451 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  36.06 
 
 
444 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.56 
 
 
452 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  36.14 
 
 
475 aa  276  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  37.13 
 
 
451 aa  274  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  36.56 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.14 
 
 
453 aa  273  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  37.9 
 
 
456 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  37.75 
 
 
454 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  35.71 
 
 
487 aa  266  8e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  34.99 
 
 
469 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  35.63 
 
 
454 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  34.94 
 
 
491 aa  264  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  34.32 
 
 
497 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  37.08 
 
 
450 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.16 
 
 
450 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.5 
 
 
451 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  35.18 
 
 
502 aa  260  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  37.47 
 
 
454 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  34.44 
 
 
453 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  35.27 
 
 
455 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  33.69 
 
 
488 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  36.54 
 
 
471 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  34.04 
 
 
479 aa  255  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.69 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.69 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.69 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  36.3 
 
 
449 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  34.53 
 
 
461 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>